Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name SEPTIN7
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr7) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name septin 7
Also known as CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A
Coordinate chr7:35800986-35915763
Strand +
Gene summary This gene encodes a protein that is highly similar to the CDC10 protein of Saccharomyces cerevisiae. The protein also shares similarity with Diff 6 of Drosophila and with H5 of mouse. Each of these similar proteins, including the yeast CDC10, contains a GTP-binding motif. The yeast CDC10 protein is a structural component of the 10 nm filament which lies inside the cytoplasmic membrane and is essential for cytokinesis. This human protein functions in gliomagenesis and in the suppression of glioma cell growth, and it is required for the association of centromere-associated protein E with the kinetochore. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Several related pseudogenes have been identified on chromosomes 5, 7, 9, 10, 11, 14, 17 and 19. [provided by RefSeq, Jul 2011]

Retrocopy(s) from SEPTIN7

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SEPTIN7P6 chr7:152367525-152369017 + Intragenic
ENSG00000241007 UCSC
SEPTIN7P1 chr14:35157704-35158994 - Intragenic
ENSG00000259090 UCSC
SEPTIN7P12 chr17:60257987-60259238 + Intragenic
ENSG00000275562 UCSC
SEPTIN7P7 chr9:98607104-98609137 + Intragenic
ENSG00000229897 UCSC
SEPTIN7P8 chr19:53771493-53773279 - Intergenic
ENSG00000229000 UCSC
SEPTIN7P10 chr5:119126314-119128425 - Intragenic
ENSG00000248885 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001011553.4
agtcgagcgagagcCTGTGGAGGAGTCCGCCTGCTGTAGCGTGCGTAAGCAAGGCAGCTACGCCGGGCGGCTACGCTGCGGAATCGGCGTAGGCGCCTTTGGAGAATCGGCGGGCTGCGCTCCGCTGGGGCTGGTCGCGGAGGGGGGGAGGGGATGTCGGTCAGTGCGAGATCCGCTGCTGCTGAGGAGAGGAGCGTCAACAGCAGCACCATGGCTCAACAGAAGAACCTTGAAGGCTATGTGGGATTTGCCAATCTCCCAAATCAAGTATACAGAAAATCGGTGAAGAGAGGTTTTGAATTCACGCTTATGGTAGTGGGTGAATCTGGATTGGGAAAGTCGACATTAATCAACTCATTATTCCTCACAGATTTGTATTCTCCAGAGTATCCAGGTCCTTCTCATAGAATTAAAAAGACTGTACAGGTGGAACAATCCAAAGTTTTAATCAAAGAAGGTGGTGTTCAGTTGCTGCTCACAATAGTTGATACCCCAGGATTTGGAGATGCAGTGGATAATAGTAATTGCTGGCAGCCTGTTATCGACTACATTGATAGTAAATTTGAGGACTACCTAAATGCAGAATCACGAGTGAACAGACGTCAGATGCCTGATAACAGGGTGCAGTGTTGTTTATACTTCATTGCTCCTTCAGGACATGGACTTAAACCATTGGATATTGAGTTTATGAAGCGTTTGCATGAAAAAGTGAATATCATCCCACTTATTGCCAAAGCAGACACACTCACACCAGAGGAATGCCAACAGTTTAAAAAACAGATAATGAAAGAAATCCAAGAACATAAAATTAAAATATACGAATTTCCAGAAACAGATGATGAAGAAGAAAATAAACTTGTTAAAAAGATAAAGGACCGTTTACCTCTTGCTGTGGTAGGTAGTAATACTATCATTGAAGTTAATGGCAAAAGGGTCAGAGGAAGGCAGTATCCTTGGGGTGTTGCTGAAGTTGAAAATGGTGAACATTGTGATTTTACAATCCTAAGAAATATGTTGATAAGAACACACATGCAGGACTTGAAAGATGTTACTAATAATGTCCACTATGAGAACTACAGAAGCAGAAAACTTGCAGCTGTGACTTATAATGGAGTTGATAACAACAAGAATAAAGGGCAGCTGACTAAGAGCCCTCTGGCACAAATGGAAGAAGAAAGAAGGGAGCATGTAGCTAAAATGAAGAagatggagatggagatggagcaggtgtttgagatgaagGTCAAAGAAAAAGTTCAAAAACTGAAGGACTCTGAAGCTGAGCTCCAGCGGCGCCATGAGCAAATGAAAAAGAATTTGGAAGCACAGCACAAAGAATTGGAGGAAAAACGTCGTCAGTTCGAGGATGAGAAAGCAAACTGGGAAGCTCAACAACGTATTTTAGAACAACAGAACTCTTCAAGAACCTTGGAAAAGAACAAGAAGAAAGGGAAGATCTTTTAAACTCTCTATTGACCACCAGTTAACGTATTAGTTGCCAATATGCCAGCTTGGACATCAGTGTTTGTTGGATCCGTTTGACCAATTTGCACCAGTTTTATCCATAATGATGGATTTAACAGCATGACAAAAATTATTTTTTTTTTTGTTCTTGATGGAGATTAAGATGCCTTGAATTGTCTAGGGTGTTCTGTACTTAGAAAGTAAGAGCTCTAAGTACCTTTCCTACATTTTCTTTTTTTATTAAACAGATATCTTCAGTTTAATGCAAGAGAACATTTTACTGTTGTACAATCATGTTCTGGTGGTTTGATTGTTTACAGGATATTCCAAAATAAAAGGACTCTGGAAGATTTTCATTGAGGATAAATTGCCATAATATGATGCAAACTGTGCTTCTCTATGATAATTACAATACAAAGGTTCCATTCAGTGCAGCATATACAATAATGTAATTTAGTCTAACACAGTTGACCCTATTTTTTGACACTTCCATTGTTTAAAAATACACATGGAAAAAAAAAAAACCCTATATGCTTACTGTGCACCTAGAGCTTTTTTATAACAACGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTTGGATTCTTTAAATATATATTATTCTCATTTAGTGCCCTCTTTAGCCAGAATCTCATTACTGCTTCATTTTTGTAATAACATTTAATTTAGATATTTTCCATATATTGGCACTGCTAAAATAGAATATAGCATCTTTCATATGGTAGGAACCAACAAGGAAACTTTCCTTTAACTCCCTTTTTACACTTTATGGTAAGTAGCAGGGGGGGAAATGCATTTATAGATCATTTCTAGGCAAAATTGTGAAGCTAATGACCAACCTGTTTCTACCTATATGCAGTCTCTTTATTTTACTAGAAATGGGAATCATGGCCTCTTGAAGAGAAAAAAGTCACCATTCTGCATTTAGCTGTATTCATATATTGCATTTCTGTATTTTTTGTTTGTATTGTAAAAAATTCACATAATAAACGATGTTGTGATGTAA
>NM_001363715.2
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