Retrocopy Name | GSPT1P2 |
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Species | Gorilla gorilla | |
Coordinates | chrX:49629210-49630919 UCSC | |
Strand | + | |
Parental Sequence | XM_019012452.2 | |
Parental seq. overlap | 1532 bp | |
Parental seq. overlap (%) | 21.5% | |
Genomic Region |
Intergenic |
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Retrocopy Summary | GSPT1P2, located on chrX:49629210-49630919, is a retrocopy of the parental gene GSPT1. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
Gene Name | GSPT1 |
Full Name | N/A |
Also known as | GSPT1 |
Coordinate | chrUn_NW_022149686v1:104279-152427 |
Strand | - |
Gene summary | N/A |
>GSPT1P2 |
TTGAAGGTTCCAATTCAGCCGTTACCATGGAACTTTCAGAACCTGTTGTAGAAAATGGAGAGGTGGAAATGGCCCTAGAAGAATCATGGGAGCACAGTAAAGAAGTAAGTGAAGCCGAGCCTGGGGGTGGTTCCTCGGGAGATTCAGGGCCCCCAGAAGAAAGTGGCCAGGAAATGATGGAGGAAAAAGAGGAAATAAGAAAATCCAAATCTGTGATCGTACCCTCAGGTGCACCTAAGAAAGAACACGTAAATGTAGTATTCATTGGCCATGTAGACGCTGGCAAGTCAACCATCGGAGGACAGATAATGTTTTTGACTGGAATGGTTGACAAAAGAACACTGGAGAAATATGAAAGAGAAGCTAAGGAAAAAAACAGAGAAACCTGGTATTTGTCCTGGGCCTTAGATACAAATCAGGAGGAACGAGACAAGGGTAAAACAGTCGAAGTGGGTCGTGCCTATTTTGAAACAGAAAGGAAACATTTCACAATTTTAGATGCCCCTGGCCACAAGAGTTTTGTCCCAAATATGATTGGTGGTGCTTCTCAAGCTGATTTGGCTGTGCTGGTCATCTCTGCCAGGAAAGGAGAGTTTGAAACTGGATTTGAAAAAGGTGGACAGACAAGAGAACATGCGATGTTGGCAAAAACGGCAGGGGTAAAACATTTAATAGTGCTTATTAATAAGATGGATGATCCCACAGTAAATTGGAGCATTGAGAGATATGAAGAATGTAAAGAAAAACTGGTGCCCTTTTTGAAAAAAGTAGGCTTCAGTCCAAAAAAGGACATTCACTTTATGCCCTGCTCAGGACTGACCGGAGCAAATATTAAAGAGCAGTCAGATTTCTGCCCTTGGTACACTGGATTACCATTTATTCCGTATTTGGATAACTTGCCAAACTTCAACAGATCAATTGATGGACCAATAAGACTGCCAATTGTGGATAAGTACAAAGATATGGGCACTGTGGTCCTGGGAAAGCTGGAATCCGGGTCCATTTTTAAAGGCCAGCAGCTCGTGATGATGCCAAACAAGCACAATGTAGAAGTTCTTGGAATACTTTCTGATGATACTGAAACTGATTTTGTAGCCCCAGGTGAAAACCTCAAAATCAGACTGAAGGGAATTGAAGAAGAAGAGATTCTTCCAGGATTCATACTTTGTGATCCTAGTAACCTCTGCCATTCTGGACGCACGTTTGATGTTCAGATAGTGATTATTGAGCACAAATCCATCATCTGCCCAGGTTATAATGCGGTGCTGCACATTCATACTTGTATTGAGGAAGTTGAGATAACAGCGTTAATCTCCTTGGTAGACAAAAAATCAGGAGAAAAAAGTAAGACACGACCCCGCTTCGTGAAACAAGATCAAGTATGCATTGCTCGTTTAAGGACAGCAGGAACCATCTGCCTCGAGACGTTCAAAGATTTTCCTCAGATGGGTCGTTTTACTTTAAGAGATGAGGGTAAGACCATTGCAATTGGAAAAGTTCTGAAACTGGTCCCGGAGAAGGACTAAGCAATTTTCTTGATGCCTCTGCAAGATACTGTGAGGAGAATTGACAGCAAAAGTTCACCACCTACTCTTATTTACTGCCCATTGATTGACTTTTCTTCATATTTTGCAAAGAGAAATTTCACAGCAAAAATTCATGTTTTGTCAGCTTTCTCATGTTGAGATCTGTTATGTCACTGATGAATTT |
>XM_019012452.2 |
ACACACGAGGAGGAGGGTTGAgccgccgccgccgcctctgtcgtcgtcgcGAGTGTGGAGTCGGGACTGGAGCTGCTGCCGCGGCGACGCCGGGATCTTTGTCGCTAGCTCCCTGCCCTTCTGCCCCGCCGCCTTCCCTCGGTCAGCGTTGCCCACTCCTCCCCGGCCGGGCGCCCCTGCCTCCATTTCCCGCTCTCTGTCCACCACACACACGGCCCCCCCGATCATGGATCCGggcagtggcggcggcggcggcggcgggagcagcagcggcggcagcagcagcgactcggcgcctgactgctgggaccaggcggacatggaagcccccgggccgggcccgtgcggcggcggcggctccctggcggcggcggccgaggcCCAGCGGGAGAACCTCAGCGCGGCCTTCAGCCGGCAACTCAACGTCAACGCCAAGCCCTTCGTGCCCAACGTCCACGCCGCCGAGTTCGTGCCGTCCTTCCTGCGGGGCCCGGCAGCGCCGCCACCCCCAGCTGGCGGCGCCGCCAATAACCACGGAGCCGGCAGCGGCGCGGGAGGTCCTGCGGCACCTGTGGAATCCTCTCAAGAGGAACAGTCATTGTGTGAAGGTTCAAATTCAGCTGTTAGCATGGAACTTTCAGAACCTATTGTAGAAAATGGAGAGACAGAAATGTCTCCAGAAGAATCATGGGAGCACAAAGAAGAAATAAGTGAAGCAGAGCCAGGGGGTGGTTCCTTGGGAGATGGAAGGCCGCCAGAGGAAAGTGCCCATGAAATGATGGAGGAGGAAGAGGAAATCCCAAAACCTAAGTCTGTGGTTGCACCGCCAGGTGCTCCTAAGAAAGAGCATGTAAATGTAGTATTCATTGGGCATGTAGATGCTGGCAAGTCAACCATTGGAGGACAAATAATGTATTTGACTGGAATGGTTGACAAAAGGACGCTTGAAAAGTATGAAAGAGAAGCTAAAGAGAAAAACAGAGAAACTTGGTACTTGTCTTGGGCCTTAGACACAAATCAGGAAGAACGAGACAAGGGTAAAACAGTAGAAGTGGGTCGTGCCTATTTTGAAACCGAAAAGAAGCATTTCACAATTCTAGATGCCCCTGGCCACAAGAGTTTTGTCCCAAATATGATTGGTGGTGCCTCTCAAGCTGATTTGGCTGTGCTGGTAATCTCAGCCAGGAAAGGAGAGTTTGAAACTGGATTTGAAAAAGGAGGACAGACAAGAGAACATGCAATGTTGGCAAAGACAGCAGGTGTAAAACACCTAATTGTGCTAATTAATAAGATGGATGATCCAACAGTAAATTGGAGCAATGAGAGATATGAAGAATGTAAGGAGAAACTAGTGCCATTTTTGAAAAAAGTTGGCTTCAATCCCAAAAAGGACATTCACTTTATGCCCTGCTCAGGACTTACTGGAGCAAATCTCAAAGAGCAGTCGGATTTCTGTCCTTGGTACATTGGATTACCGTTTATTCCATATCTGGATAATTTGCCAAACTTCAATAGATCAGTTGATGGACCAATCAGGCTGCCAATTGTGGATAAGTACAAGGATATGGGCACTGTGGTCCTGGGAAAGCTGGAATCAGGATCTATTTGTAAAGGCCAGCAGCTTGTGATGATGCCAAACAAGCACAACGTGGAAGTTCTTGGAATACTTTCCGATGATGTAGAGACTGATACCGTAGCCCCAGGTGAAAACCTCAAAATCAGACTGAAAGGAATTGAAGAAGAGGAGATTCTTCCAGGGTTTATACTTTGTGATCCTAATAATCTTTGTCATTCTGGACGCACATTTGATGCCCAGATAGTGATTATAGAGCACAAATCCATCATCTGCCCAGGCTATAATGCGGTGCTGCATATTCATACCTGTATTGAGGAGGTCGAAATAACAGCCTTAATCTGCTTGGTAGACAAAAAATCAGGAGAAAAAAGTAAGACCCGACCCCGTTTTGTGAAACAAGATCAAGTATGCATTGCTCGCTTAAGGACAGCAGGAACCATCTGCCTGGAGACCTTTAAAGACTTCCCTCAGATGGGTCGTTTCACCTTAAGAGATGAGGGTAAGACCATTGCAATTGGAAAAGTTCTGAAACTGGTTCCAGAGAAAGACTAAGCATTTTCTTGATGACCCTGCACAATACTGTGAGGAAAATTGACTGCAGAAGCCTACTTCACACCGCCTTCTCTTATTTTCTGCCCATTGATAAACCTCTCCCCATATTTTGCAAAGAGGAAATTAACAGCAAAAGTCCACATTATGTCAGCTTTCTCATATTGAGAGCTCTGCTATGCCACTGTTGAATTTTTCCCAAGATTCCTGTCCCTAGCCCTCACTTCAAACTCTGCTTCCTTGGACAGATTTGGCAATAGCTTTGTAAGTGATGTGGACATAATTGCCTACAATAATGAAAACCTACAGGAATTTTTTTATTTTTCATTTTCCCCTTAGGCATATTTAGTATTTTTCCCCCAGGCAGATCATTCTGAGTGTGCGAGTGTGTGTGCACATGTTACAAAGGCAACTACCGTGTTAATAAAATATTCAATTTGAAATCCTTTTCGGTATTTGAATTGCTTTTGAATAATCTTTTTTATCTGGATGTAACATTGTTGCATTAACTTTTTAACTTTCCCAAGTAATTGAATACATTTTATTACTTGGACTTTTATAAACTCTTTCCCTACCCACTATAAATGAGGCATTCACAGTGTTCAAGTTTGTATTAAAGGAAAGGATTAGTTTGACCCCTTCTTTTGATGGTTAATGCATACATGCAGTTAAATCCCTTTATGCAAATGTGACACTGCTTTACTAGGTCTtttagttatttatttatttatttttttGGCCAATTTATATTGTAACATGATTTCTTGAACACAGTAAGTTGTTTTAAAATAAAAGAACAGCATACTGTAGTTTTTATAAGTAAAGCGTAATGAAATTGTACCCCTAGAGAAAATTCCATTAACTCATTAAATTAGTGGAATTAACAACAAATAAAGCATGTTTGAGACCTGGCAAAAATTCCTCTGTTAGTATTTATAAGAGCTGCATGCCTCTAGTATGAAAACCGTATCAGTTGCAAGTGCCACTTCTACAAGTTACTCAGTTTACTCTTTGTATCAGTAACTTTAAAGGTTGGATGATCCTTGCTGGTTAAAGCTAAATCTCAACCCAGCAACTAAATGAAAATATTTAGAATCATCAGAATCTGAACAGACTAAAATTATCAGTGATAAGCAGAATCAAGCAGGGTGTAAGTTTTATCTCAATTATTTGAAATTGACTGAGTTTTCTTAAGTGTAAAACTGAAATTTGCTAACCATGTTTTTGATGAACCACAGTGCAGCATTGTGGTGGTTTTAGATTGAATGACTCTGCTATAATTATCATGACTTTGAAATTTTTCATGAGAATAAATGAGGAATGGAGGCAATTTGTGGGTTTATCCAAAGCCCCCTTGATGTTGAGTGTTGCCATTGATCAAAGATAGCCTCTTTTAGATTGTGATTTCTCTCTAAATAAGATACTTTGTATATTTAATGACAAGTCCCTTCCCTATAATTTTGCTCCTCAGAAAAGCCTAGACAGACTGTATTTCCAGTCACAGAACATAAAACTTATCTAATGGGTGttttgttttgttttgagacagaggctcactctgtcacctaggctggagtgcagtggctcaatctcagctcactgcagcctccacctcccggattcaagcaatttcctgcctcagcctcttgagtagctgggattacaggagccctccaccaggcccagttaatttttgtatttttagtggagacgaggtttccccatattggtcaggctggtctcaaacttctgacctcaagtgatccgctcgcctcagcctctcaaaagtgctgggattacaggcatgaggcgccgcacttggccTAGTGTTTTCTTAACTGTGAAATTCCCATTCATTTCTTGAATGAGGCTACATCTTATGGACAGAGCAAAGTTACTGTCCTACAGATTCTTAAAACTATAATTATGGCTATTGCATGAAATTTAAATAGATTTTATTATGTCTGCAAATCTCTGGGCTTTTATTTTTCTGGAAAATATAGGAGCTTTAATCAAAACATAATAGTTCTTTTTGTAATTCCATGTTAATAAAAACAAATACTAGCAATTGCTTGAATTTTAATGAATATTTAAAAGTTCAAGAGCCACGGAAATCACTTCCAGAGATAAGAGTTCCCTTTCTAAATATAACACACTTTTTAAAAATAAGTTATGTTTGCTACTAAAACATTTACACTGTTAGACTATTATGTGCATGTTGCCAAGACTCTTAAGTAACTTGGATATCAACTGTGAAGGGCCTACCTCTAAAATTAAGTAACAGGTCATACAAATACAAATGTAACTGTAAAAATTCCACTGGATTCTTGCATATTTGCAAGATTAGATTATTCAAAAGAAATTTCAGTGCTAAAATTAACCAGCAACATAAGTTCTATGGGCTTTGAAAGTTGTTCTCATCTTTTTAAAGTTGATGGCATTTTCAATCCTGCTTACACAGGCTGTTCATTTGGATAAGGAAATAAAATGTCTAAGGTGAACTTGGCATTATGTGGAGATGTTGGACCGTTATAGAGCAATACAAATTCCTATGCTGTCATTCTGTTTTCTGCAAATGCAAACGTGCTTATATGGTCAACAGTGCAAAAATAGGGTAGTTGGCTGCATATTTAGGGTATTACCTAAGCATTTGTTCTCTAACGTTGCTCTACTAGAATGATTTTTTTCTTGCATCTTTTCACATTAATGATGTTCTTTATATAACTTTCATGCGATTATTTAGTTTTTTAAATTAATAAAGTGAATTTAAGAAATATTGAAATAAACATCTAAGTAATTGCCATTTTAAACCCTTGTTTCTTACTGTGGGAGAGGGGGAAATACAGCACTCATTTCTTGTTTTTAATTTGCAAAA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