Retrocopy Name | GSPT1P2 |
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Species | Chlorocebus sabaeus | |
Coordinates | chrX:48463861-48465431 UCSC | |
Strand | + | |
Parental Sequence | XM_007985982.1 | |
Parental seq. overlap | 1418 bp | |
Parental seq. overlap (%) | 19.9% | |
Genomic Region |
Intragenic (METTL4) |
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Retrocopy Summary | GSPT1P2, located on chrX:48463861-48465431, is a retrocopy of the parental gene GSPT1. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
Gene Name | GSPT1 |
Full Name | N/A |
Also known as | - |
Coordinate | chr5:11335211-11382904 |
Strand | - |
Gene summary | N/A |
>GSPT1P2 |
TTGAAGGTTCCAATTCAGCCGTTACCATGGAACTTTCAGAACCTGTTGTAGAAAATGGAGAGGTGGAAATGGCCCTAGAAGAATCATGGGAGCACAGTAAAGAAGTAAGTGAAGCTGAGCCTGGGGGTGGTTCCTCGGGAGATTCGGGGCCCCCAGAAGAAAGTGGCCAGGAAATGATGGAGGAAAAAGAGGAAATAAGAAAATCCAAATATATGATTGTACCCTCAGGTGCTCCTAAGAAAGAACACGTAAATGTAGTATTCATTGGCCATGTAGACGCTGGCAAGTCAACCATCGGAGGACAGATAATGTTTTTGACTGGAATGGTTGACAAAAGAACACTGGAGAAATATGAAAGAGAAGCTAAGGAGAAAAACAGAGAAACATGGTATTTGTCCTGGGCCTTAGATACAAATCAGGAAGAACGAGACAAGGGTAAAACAGTCGAAGTGGGTCGTGCTTATTTTGAAACAGAAAGGAAACATTTCACAATTTTAGATGCCCCTGGCCACAAGAGTTTTGTCCCAAATATGATTGGTGGTGCTTCTCAAGCTGATTTGGCTGTGCTGGTCATCTCTGCCAGGAAAGGAGAGTTTGAAACTGGATTTGAAAAAGGTGGACAGACAAGAGAACATGCGATGTTGGCAAAAACGGCAGGGGTAAAACATTTAATAGTGCTTATTAATAAGATGGATGATCCCACAGTAAATTGGAGCATCGAGAGATATGAAGAATGTAAAGAAAAACTGGTACCCTTTTTGAAAAAAGTCGGCTTCAGTCCAAAAAAGGACATTCACTTTATGCCCTGCTCAGGACTGACCGGAGCAAATATTAAAGAGCAATCAGATTTCTGCCCTTGGTACACTGGATTACCATTTATTCCGTATTTGGATAACTTGCCAAACTTCAACAGATCAATTGATGGACCCATAAGACTGCCAATTGTGGATAAGTACAAGGATATGGGCACTGTGGTCCTGGGAAAGCTGGAATCTGGGTCCATTTTTAAAGGCCAGCAGCTTGTGATGATGCCAAACAAGCACAATGTAGAAGTTCTTGGAATACTTTCTGATGATACTGAAACTGATTTTGTAGCCCCAGGTGAAAACCTCAAAATCAGACTGAAGGGAATTGAAGAAGAAGAGATTCTTCCAGGATTCATACTTTGTGATCCTAGTAACCTCTGCCATTCTGGACGCACGTTTGATGTTCAGATAGTGATTATTGAGCACAAATCCATCATCTGCCCAGGTTATAATGCGGTGCTGCACATTCATACTTGCATTGAGGAAGTTGAGATAACAGCCTTAATCTCCTTGGTAGACAAAAAATCAGGAGAAAAAAGTAAGACACGACCCCGCTTCGTGAAACAAGATCAAGTATGCATTGCTCGTTTAAGGACAGCAGGAACCATCTGCCTCGAGACGTTCAAAGATTTTCCTCAGATGGGTCGTTTTACTTTAAGAGATGAGGGTAAGACCATTGCAATTGGAAAAGTTCTGAAACTGGTCCCAGAGAAGGACTAAGCAATTTTCTTGATGCCTCTGCAAGATACTGTGAGAAGAATTGAC |
>XM_007985982.1 |
AGATCCGCTCGCAGACACGAGGAGGAGGGTTGAgccgccgccgccgtcgcctctgtcgtcgtcgcGAGTGTGGAGTCGGGACTGGAGCTGCTGCCGCGGCGACGCCGGGGATCTTTGTCGCTAGCTCCCGGCCCTTCTGCCCCGCCGCCTTCTCTCGGTCAGCGCGGCCCACTCCTCCCCGGCCGGGCGCCCCTGCCTCCATTTCCCGCTCTCTGTCCACCACACACACGGCCCCCCCGATCATGGATCCGGGCAGTggcggcggcggcggcggcggcggcggcggcggGagcagcagcggcagcagcagcagcGACTCGGCGCCCGACTGCTGGGACCAGGCGGACATGGAAGCCCCCGGGCCGGGCCCGTGTggcggcggcggcggcggctccctggcggcggcggccgaggcCCAGCGGGAGAACCTCAGCGCGGCCTTCAGCCGGCAACTCAACGTCAACGCCAAGCCCTTCGTGCCCAACGTCCACGCCGCCGAGTTCGTGCCGTCCTTCCTGCGGGGCCCGGCAGCGCCGCCACCCCCAGCTGGCGGCGCCGCCACCAACCACGGAGCCGGCAGCGGCGCGGGAGGCCCTGCGGCACCTGTGGAATCCTCTCAAGAGGGACAGTCATTGTGTGAAGGTTCAAATTCAGCTGTTAGCATGGAACTTTCAGAACCTATTGTAGAAAATGGAGAGACAGAAATGTCTCCAGAAGAATCATGGGAGCACAAAGAAGAAATAAGTGAAGCAGAGCCAGGGGTTGGTTCCTTGGGAGATGGAAGGCCGCCAGAGGAAAGTGCCCATGAAATGATGGAGGAGGAAGAGGAGATCCCAAAACCTAAGTCTGTGGTTGCACCACCAGGTGCTCCTAAGAAAGAGCATGTAAATGTAGTATTCATTGGGCATGTAGATGCTGGCAAGTCAACCATTGGAGGACAAATAATGTATTTGACTGGAATGGTTGACAAAAGGACACTTGAAAAGTATGAAAGAGAAGCTAAAGAGAAAAACAGAGAAACTTGGTACTTGTCTTGGGCCTTAGACACAAATCAGGAAGAACGAGACAAAGGTAAAACAGTAGAAGTGGGTCGTGCCTATTTTGAAACCGAAAAGAAGCATTTCACAATTCTAGATGCCCCTGGCCACAAGAGTTTTGTCCCAAATATGATTGGTGGTGCCTCTCAAGCTGATCTGGCTGTGCTGGTAATCTCAGCCAGGAAAGGAGAGTTTGAAACTGGATTTGAAAAAGGAGGACAGACAAGAGAACATGCAATGTTGGCAAAGACAGCAGGTGTAAAACACCTAATTGTGCTAATTAATAAGATGGATGATCCAACAGTAAATTGGAGCAATGAGAGATATGAAGAATGTAAAGAGAAACTAGTGCCATTTTTGAAAAAAGTTGGCTTCAATCCCAAAAAGGACATTCACTTTATGCCCTGCTCAGGACTTACTGGAGCAAATCTCAAAGAGCAGTCGGATTTCTGTCCTTGGTACATTGGATTACCATTTATTCCATATCTGGATAATTTGCCAAACTTCAATAGATCAGTTGATGGACCAATCAGGCTGCCAATTGTGGATAAGTACAAGGATATGGGCACTGTGGTCCTGGGAAAGCTGGAATCAGGATCTATTTGTAAAGGCCAGCAGCTTGTGATGATGCCAAACAAGCACAACGTGGAAGTTCTTGGAATACTTTCTGATGATGTAGAAACGGATACTGTAGCCCCAGGGGAAAACCTCAAAATCAGACTGAAAGGAATTGAAGAAGAGGAGATTCTTCCCGGATTTATACTTTGTGATCCTAATAATCTTTGTCATTCTGGACGCACATTTGATGCCCAGATAGTGATTATAGAGCACAAATCCATCATCTGCCCAGGCTATAATGCGGTGCTGCATATTCATACCTGTATTGAGGAAGTCGAAATAACAGCCTTAATCTGCTTGGTAGACAAAAAATCAGGAGAAAAAAGTAAGACCCGACCCCGTTTTGTGAAACAAGATCAAGTATGCATTGCTCGCTTAAGGACAGCAGGAACCATCTGCCTGGAGACCTTTAAAGACTTCCCTCAGATGGGTCGTTTTACCTTAAGAGATGAGGGTAAGACCATTGCAATTGGAAAAGTTCTGAAACTGGTTCCAGAGAAAGACTAAGCATTTTCTTGATGACCCTGCACAATACTGTGAGGAAAATTGACTGCAAAAGCCTACTTCACACCGCCTTCTCTTATTTTCTGCCCATAAACCTCTCCCCGTATTTTGCAAAGGGGAAATTCACAGCAAAAGTCCACATTATGTCAGCTTTCTCATATTGAGAGCTCTGCTATGCCACTGTTGAATTTTTCCCAAGATTCCCATCCCTAGCCCCCTCTTCAAACTCTGCTTCCTTGGACAGATTTGGCAGTAGCTTTGTAAGTGATGTGGACATAATTGCCTACAATAATGAAAACCTACAGGAATTTTTTTATTTTTCATTTTCCCCTTAGGCATATTTAGTATTTTTTCCCCAGGCAGATCATTCTGAGTGTGCGAGTGTGTGTGCACATGTTACAAAGGCAACTACCATGTTAATAAAATATTCAATTTGAAATCCTTTTCGGTATTTGAATTGCTTTTGAATAATGTTTTTTATCTGGATGTAACATTGTTGCATTAGCTTTTTAACTTTCCCAAGTAATTGAATACATTTTATTACTTGGACTTTTATAAACTCTTTCCCCACCCACTATAAATGAGGCATTCACAGTGTTCAAGTTTGTATTAAAGGAAAGGATTAGTTTGACCCCTTCTTTTGATTGTTAATGCATACATGCAGTTAAATCCCTTTATCCAAATGTGACACTGCTTCACTAGGTCTtttagttatttatttatttttttTCCAATTATATTGTAACATGATTTCTTAAACACAGTAAGTTGTTTTAAAATGAACAGCGTACTGTAGTTTTTGTAAGTAAAGCATAATGAAATTGTACCCCGAGAGAAAATTCCATTAACTCGTTAAATTAGTGGAATTTACAACAAATAAAGCATGTTTAAGACCTGGCAAAAATTCCTCTTTTAGTATTTATAAGAGCTGCATGCTTCTAGTATGAAAACCGTATCAGTTGCAAGTGCCACTTCTACAAGTTACCCAGTTTACTCTTTTTACCAATAACTTTGAAGGTTGGATGATCCTTGCTGGTTAAAGCTAAATCTCAACCCAGCAACTAAATAAACATATTTCGAATCATCAGAATCTGCACAGACTAAAATTATCATCGATAAGTAGAATCAAGCACAGTGTAAGTTTTATCTCAATTATTTGAAATGCACTGAGTTTTCTTAAGTGTAAAGCTGAAATTTGCTCACCATGTTTTTGATGAACCACAGTGCAGCACTATGGTGGTTTTAGATTGAATGACTTTGTGCTATAATTATCATGACTGAAATTTTTCATGAGAAAAATGAGGAATGGAGGCAATTTGTAGGTTTATCCGAAGCCCCCTTGATGTTGAGTGTTGCCATTTATCAAAGAGGGCCTCTTTTAGATTGTGATTTCTGTCTAAATAAGGTACTTTGTAATTGTATATTTAATGACAAGTCCTTTCCCTATAATTTTGCTCCTCAGAAAAGAAAAGCCTGGACAGACTGTATTTCCAGTCACAGAACATAAAACTTAATCTGTTGGGTGttttgttctgttttgagacagaggcttactctgtcacctaggctggagtgcagtggctcgatctcggctcactgcagcctccacctcccggattcaatttcctgcctcagcctcttgagtagctgggattacaggagcccaccaccaggcccagttaatttttgtagttttagtagagacgaggtttcaccatattggccaggctgctctcaaactcctgacctcaagtggtccactcgcttcagcctctcaaaagtgctaggattacaggcgtgaggcgccatgcttggccTAGTGTTTTCTTAACTGTGAAATTCCCATTCATTTCATGAATGAGGCTACATCTTATGGACAGAGCAAAGTTATTGTTTTACAGATTCTTAAAATTATAATTATGGCTATTGCATGAAATTTAAATAAATTTTATTATGTCTGCAAATATCTGGGCTTTTATTTTTCTGGAAAATATAGGAGCTTTAATCAAAACATAATAGTTCTTTTTGTAATTCCATGTTATTAAAAACAAATACTAATAATTGCTTGAATTTTAATGAATATTTAAAAGTTCAAGAGCCACTGAAATCATTTCCAGAGATAAGAGTTTCCTTTCTAAATTGAACACATTTTTAAAAAATAAGTTATGTTTGCTACTAAAACATTTGCACTGTTAGAATATTATGTGCATGTTGCCAAGACTCTTAAGTAACTTGGATATCAACTGTGAAAGGCCTACCTCTAAAAAGTAACAGGTCATACAAATACAAATGTAACTGTAAAAACTCCACTGGATTCTTGCATATTTGCAAGATTAGATTATTCAAAAGAATTTCAATGCTAAAATTAACCAGCAACATAAGTTCTATGGGCTTTGAGAATTGTTCTCATCTTTTTAAGGTTAATGCATTTTCAAATCCTGCTTACAGGGGCTATTCATTTGGATAAGGAAGTAAAATGTCTAAGGTGAACTTGGCATTATGTGGAGACATTGGACCTTTATATAGAGCAATACAAATTCCTGTGCTGTCATTCTGTCTTCTGCAAATGCAAACGTGTTTAGATGGTCGACAGTGCAAAAATAGGGTAGTTGGCTGCATATTTAGGGTATTACCTAAGCATTTGTTCTCTATCTTTAACGTTGTTCTACTAGAATGATTTTTTTCTTGCATCTTTTCACATTAATGATGTTCTTTATATAACTTTCATGCTAGATTATTTAATTAGTTTTTTAAATTAATAAAGTGAATTTAAGAAATGTTGAAATAAACATCTAAGTAATTGCCATTTTAAACCCTTGTTTCTTACTGTGGGAGGGGGGA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