Retrocopy Name | IPO5P1 |
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Species | Chlorocebus sabaeus | |
Coordinates | chr12:73488627-73491757 UCSC | |
Strand | + | |
Parental Sequence | XM_007960721.1 | |
Parental seq. overlap | 2588 bp | |
Parental seq. overlap (%) | 56.1% | |
Genomic Region |
Intragenic (ZHX3) |
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Retrocopy Summary | IPO5P1, located on chr12:73488627-73491757, is a retrocopy of the parental gene IPO5. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
Gene Name | IPO5 |
Full Name | N/A |
Also known as | - |
Coordinate | chr3:76644113-76690718 |
Strand | + |
Gene summary | N/A |
>IPO5P1 |
AGCAGAGGAAATCTATGAAAATATCCCAGGTCTGTGTAAGACTACCTTCCTCTTAGATGCCGTCAGAAATAGAAGAGCAGGTTATGAGGTGAGACAAATGGCTGCCGCACTGCTACGACGGCTTTTGTCCTCTGGGTTTGAGGAGGTTTATCCAAATCTGCCTGCTGATGTTCAGAGGGATGTCAAGATTGAACTGATTCTGGCTGTTAAGTTAGAAACACATGCTAGCATGAGGAAAAAACTTTGTGATATTTTTGCAGTGCTGGCCAGGAATTTGATAGATGAGGATGGTACTAACCACTGGCCGGAAGGTCTGAAGTTTCTTATTGATTCAATCTACTCTAAAAATGTGGTTCTATGGGAAGTTGCACTTCACGTTTTCTGGCACTTTCCTGGGATTTTTGGGACCCAAGAGCGGCATGATTTGGATATCATCAAACGGTTGTTGGACCAATGTATTCAAGATCAAGAACATCCAGCAATCAGGACATTATCCGCTAGAGCTGCAGCTGCATTTGTACTTGCTAATGAGAATAATATTGCTCTTTTCAAAGACTTTGCAGACTTGCTTCCTGGAATCTTACAGGCTGTGAATGACTCATGCTACCAGGATGATGATTCAGTGCTAGAATCCCTTGTCGAGATCGCAGATACCGTACCTAAGTACTTGGGTCCTTATTTAGAAGATACTCTACAGTTGAGTTTGAAGTTATGTGGAGACTCTAGGCTTAGTAATCTGCAGCGCCAGCTGGCCCTCGAAGTTATAGTGACCTTGTCTGAAACTGCCACTCCGATGTTGAAAAAACATACAAATATTATTGCACAGGCAGTTCCTCATATATTAGCAATGATGGTTGATCTACAAGATGATGAGGACTGGGTAAATGCTGATGAAATGGAAGAAGATGATTTTGACAGCAATGCAGTTGCTGCGGAGAGTGCACTAGACAGACTGGCTTGTGGGCTTGGTGGAAAAGTTGTTTTACCAATGACCAAGGAGCATATCATGCAGATGCTTCAGAGCCCTGACTGGAAGTATCGACATGCTGGATTAATGGCCTTATCTGCCATTGGAGAAGGATGCCATCAACAAATGGAATCAATTCTAGATGAAACAGTTAACTCCGTTTTGCTTTTTCTTCAGGATCCTCATCCAAGGGTGAGGGCTGCAGCCTGTACTACACTTGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTAATTTCCAAAAGAAATTTCATGAAACAGTGATTGCAGCTTTGTTACGTACCATGGAAAATCAAGGTAATCAGCGTGTGCAATCACATGCAGCTTCTGCTCTTATTATTTTTATTGAAGACTGCCCCAAATCATTGCTAGTTCTATATTTGGATAGTATGGTGAAAAATCTACATTCCATCTTGGTGATTAAACTTCAAGAGTTGATTCGGAATGGAACTAAATTGGCTTTGGAACAACTTGTGACAACCATTGCATCAGTTGCAGATACAATAGAAGAAAAATTTGTCCCATATTATGATATATTCATGCCCTCACTAAAGCACATCGTTGAGCTTGCTGTTCAGAAGGAACTTAAGCTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAGTGCATTAGCCATATTGGTCTTGCCGTTGGGAAGGAAAAATTTATGCAAGATGCATCAAATGTGATGCAGCTGTTGTTGAAGACACAATCAGACTTAAATAATATGGAAGATGATGACCCTCAGACCTCTTACATGGTTTCAGCATGGGCTAGAATGTGTAAAATTCTTGGAAAAGATTTTCAACAGTACCTTCCACTAGTTATCGAGCCTCTTATTAAGACTGCTTCAGCTAAACCTGATGTTGCTCTCTTAGACACACAGGATGTGGAGAATATGAGTGATGATGATGGCTGGCAATTTGTAAATCTTGGAGACCAGCAGAGTTTTGGAATTAAAACTTCAGGACTTGAAGCAAAAGCAACTGCTTGCCAAATGTTGGTTTACTATGCTAAGGAGTTAAGGGAAGGGTTTGTGGAATATACAGAACAAGTTGTGAAGCTGATGGTTCCTTTACTGAAATTTTATTTCCATGACAATGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAGTCCATGCCTTTTCTCCTGGAATGTGCAAGAATTCGTGGCCCAGAGTATCTTGCACACATGTGGCAATTCATATGTGACCCCTTAATCAAGGCTATTGGTACTGAACCGGATACAGATGTGCTCTCGGAAATAATGAATTCTTTTGCAAAGTCCATTGAAGTTATGGGAGATGGTTGCCTTAATGATGAACACTTGGAAGAACTGGGAGGAATACTGAAAGCAAAACTTGAAGGGCACTTTAAAAACCAAGAATTGAGACAGGTTAAAAGACAGGAAGAAAACTATGATCAACAGGTTGAGATGTCTCTGCAAGATGAGGATGAATGTGATGTTTATATTCTGACCAAAGTATCAGATATTTTGCACTCATTATTTAGTACTTATAAGGAAAAGATTTTACCATGGTTTGAACAACTACTTCCATTAATTGTAAATCTAATTTGTTCAAGTAGGCCATGGCCAGACAGACAGTGGGGATTGTGCATATTTGATGACATCATAGAGCACTGCAGTCCAACTTCATTTAAATATGTAGAATATTTTCGGTGGCCAATGCTACTAAATATGCGAGATAACAACCCTGAAGTCAGGCAAGCTGCTGCTTATGGCCTGGGTGTCATGGCACAGTTTGGTGGAGATGATTATCGTTCTTTATGTTCAGAAGCTGTTCCACTGCTGGTAAAAGTTATTAAGTGTGCAAATTCCAAAACCAAAAAAAATGTCATTGCTACAGAGAACTGTATCTCAGCAATAGGGAAGATTTTGAAGTTTAAGCCTAACTGTGTAAATGTAGATGAAGTTCTTCCACACTGGTTATCATGGCTTCCACTGCATGAAGATAAAGAGGAAGCTATTCAGACTTTGAGTTTTCTCTGTGACCTAATTGAAAGTAACCACCCAGTTGTAATTGGTCCAAATAATTCCAATCTTCCCAAAATAATCAGTATAATTGCAGAAGGAAAAATTAATGAGACTATTAACTATGAAGATCCTTGTGCCAAACGTCTAGCTAATGTCGTGCGTCAGGTACAGACTTCTG |
>XM_007960721.1 |
CCCTCCCGCGGCCCGCGAGCGCGCCTCACGGCTCCTGTCTCCCCTCCCTCCTTCTCTCTCACGCCTAGCGCAATGGCGGCGGCCGCGGCGGAGCAGCAACAGTTCTACCTGCTCCTGGGAAACCTGCTCAGCCCCGACAATGTGGTCCGGAAACAGGCAGAGGAAACCTATGAGAATATCCCAGGCCAGTCAAAGATCACATTCCTCTTACAAGCCATCAGAAATACGACAGCTGCTGAAGAGGCTAGACAAATGGCCGCCGTTCTCCTAAGACGTCTCTTGTCCTCTGCATTTGATGAAGTCTATCCAACACTTCCCTCTGATGTTCAGACTGCCATCAAGAGTGAGCTACTCATAATTATTCAGATGGAAACACAATCTAGTATGAGGAAAAAAGTTTGTGATATTGCGGCAGAACTGGCCAGGAATTTAATAGATGAAGATGGCAATAACCAGTGGCCCGAAGGTTTGAAGTTCCTTTTTGATTCGGTCAGCTCTCAAAATGTGGGACTGCGGGAAGCTGCCCTTCACATTTTCTGGAACTTCCCTGGAATTTTTGGGAACCAGCAGCAGCACTATTTAGACGTCATCAAACGGATGTTAGTTCAGTGTATGCAAGATCAGGAACACCCGTCGATTAGAACTTTATCTGCTAGAGCTACAGCTGCATTTATACTTGCAAATGAGCATAATGTTGCTCTGTTCAAACATTTTGCAGACTTGCTACCAGGATTTCTACAGGCTGTAAATGACTCGTGCTACCAGAATGATGATTCTGTCCTAAAATCCCTTGTTGAGATTGCAGATACTGTTCCAAAGTATTTGCGTCCTCACTTGGAAGCAACTCTACAGCTAAGTCTAAAGTTGTGTGGAGACACTAGCCTCAACAATATGCAACGCCAGCTTGCCCTTGAAGTGATTGTCACCCTCTCTGAGACTGCAGCTGCTATGTTAAGAAAACATACCAATATTGTTGCACAGACTATTCCTCAGATGTTAGCAATGATGGTTGATTTGGAAGAAGATGAGGACTGGGCAAATGCAGATGAACTAGAAGATGATGATTTTGACAGCAATGCAGTTGCAGGCGAGAGTGCTCTAGACCGAATGGCTTGTGGACTTGGTGGAAAGCTCGTTCTGCCGATGATCAAGGAACACATTATGCAAATGCTTCAAAATCCTGACTGGAAATACCGGCATGCAGGATTGATGGCCTTATCTGCCATTGGTGAAGGGTGCCACCAGCAAATGGAAGGAATTCTAAATGAGATAGTAAATTTTGTTTTACTTTTTCTTCAGGATCCTCATCCACGAGTGAGGTATGCAGCCTGTAATGCCGTGGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTGGTTTCCAAAAGAAATTTCATGAGAAGGTGATTGCAGCTCTGCTGCAGACCATGGAAGACCAAGGCAATCAACGTGTGCAGGCCCATGCAGCTGCTGCCCTCATTAACTTCACTGAAGACTGTCCCAAGTCACTACTTATTCCATACTTGGATAATTTGGTGAAACATCTGCATTCCATTATGGTACTTAAGCTTCAAGAGCTGATTCAGAAAGGCACCAAGTTAGTTCTGGAACAAGTCGTGACATCCATTGCGTCAGTTGCAGATACTGCAGAAGAAAAATTTGTCCCCTACTATGATTTATTTATGCCATCACTGAAGCACATCGTTGAGAATGCGGTTCAAAAAGAACTGAGACTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAATGCATTAGCCTCATTGGTCTGGCTGTTGGGAAGGAAAAATTCATGCAGGATGCATCAGATGTGATGCAGCTATTGTTAAAGACCCAGACAGACTTCAATGACATGGAAGATGATGATCCTCAGATCTCTTACATGATCTCAGCATGGGCCAGAATGTGCAAAATCCTTGGAAAAGAATTTCAGCAGTACCTTCCAGTGGTTATGGGGCCTTTAATGAAGACGGCTTCAATTAAGCCCGAAGTAGCCCTTTTAGATACCCAAGACATGGAGAATATGAGTGATGATGATGGTTGGGAATTTGTGAACCTTGGAGATCAGCAAAGCTTTGGTATTAAAACTGCAGGACTAGAAGAAAAATCAACTGCTTGCCAGATGTTGGTTTGCTATGCTAAGGAGTTAAAGGAAGGTTTTGTGGAGTACACCGAACAGGTTGTCAAACTGATGGTCCCTTTACTGAAGTTTTATTTCCACGATGGTGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAATCCATGCCTCTTCTCCTGGAGTGTGCAAGAGTCCGTGGTCCTGAGTATCTCACACAGATGTGGCATTTTATGTGTGATGCTCTAATTAAGGCCATTGGTACAGAACCAGATTCAGACGTCCTCTCAGAAATAATGCATTCTTTTGCAAAGTGCATTGAAGTAATGGGAGATGGATGCCTTAATAATGAACACTTTGAAGAACTGGGAGGTATATTGAAAGCAAAGCTTGAAGAACATTTTAAAAATCAAGAATTACGACAAGTTAAAAGACAAGATGAAGACTATGATGAACAGGTCGAAGAGTCACTACAAGATGAGGATGATAATGATGTTTATATTCTGACCAAAGTGTCAGATATTTTACATTCAATATTCAGTAGCTACAAAGAAAAGGTATTACCATGGTTTGAACAGCTGCTTCCGTTAATTGTCAACCTCATTTGTCCACATAGACCATGGCCAGACAGACAATGGGGATTATGCATCTTTGATGATGTCATAGAACACTGTAGTCCAGCCTCATTTAAATATGCAGAATATTTCTTAAGACCAATGCTCCAATATGTATGTGACAACAGCCCAGAAGTCAGGCAAGCAGCTGCATATGGCCTGGGAGTCATGGCACAGTATGGTGGAGATAATTATCGCCCTTTTTGTACAGAAGCACTTCCCCTGCTGGTAAGAGTTATTCAGTCTGCGGATTCTAAGACCAAAGAAAATGTCAATGCTACAGAGAACTGCATCTCAGCAGTAGGGAAAATCATGAAGTTCAAGCCTGACTGTGTAAATGTTGAAGAGGTCCTTCCACACTGGTTGTCTTGGCTTCCACTACATGAAGATAAAGAAGAAGCTGTTCAGACTTTCAATTATCTGTGTGACCTGATTGAAAGTAATCATCCAATTGTTCTTGGCCCAAACAATACCAATCTGCCCAAAATATTTAGTATAATTGCGGAAGGAGAAATGCACGAGGCAATTAAACATGAAGATCCTTGTGCCAAACGTCTGGCCAATGTCGTTCGCCAAGTACAGACTTCTGGAGGACTGTGGACTGAGTGCATAGCACAGCTCAGTCCTGAGCAGCAGGCCGCCATTCAGGAGCTCCTGAACTCTGCGTGAAGGGCCTTAATGTCACCCACCAGAAAACTAACTCCAAATAAACGCTTACCCTTTCGTTTAGGTTTCTTTGTTTTGTTTTTGAGCAAAAGAGAGTGGTAGTGGTGTGTGTAGGCCATTCTGGAGAGCCATGAGCAGGAAGAGCAGCGCTGTGTTGCAGAATGGAGTTTCCATGGATTTCTACCAGACCAGTGAAGGAGTTCCTGGAAGCCCTGCAGTAGCACTGAAGAGTATTTTTCTATTGGTATAACCCACCCACCTGAAGGGGAAAGGGAAATCAAATTAATTTTTCTCGTTAGACGTAAGGAAATTTAAGGAAAAACAGCTTTAAGAACAGTTACTCAGCGTAGATGTGTGTTCACACAGATTGCTCTGCACTCAGTGTTCATTGTTAATTGGAGTGTGAGTCTTTCTGTAGGGTAGAAAGAAGCCTACTACCCAGCAAACCACTAGACCTAAAAGTTGAAAAAAACTGATGACAGACAAGCAGCATGAAGATGGCATATTTGATGTCACTTTGGTTCTTTTTCCCAGAAGGCTTATACAGTGACTCAGTCGGGAAGCTTTCCAGCTTCCAGCCCTTGAATGTGAAGTGTCATTGGCATGTCTGGCAGTAGTCTCTTATTCACTCCTCAATAAACAACATTGAATACAAAAGAGGCTTGTGTAAAAACTCTACTGTCTGGCTTGGATTCATTTCATGTTTTTACTATAAGAATGATCTAATATTTTTTTAAAGTAATAGCTATCAGTAATAGCTGAGTGTTTTTTCCCCTAATATTTTCCTTGTGCAATTCAGACTTAAGCATTGAGTTTTTACCATCTTCCACTGTAAGCTAAGTTATGATACCTATTCCATTCACAATTGGTGTTCTTTTTAAGGTTTGCAAATTTCAGCCAATTTTGTAGCTAGGATTGTTCTGATTAGCTCAAAAAGATTTGGCTTAGTGTTTTCATTGCAAATTATAATTGCTGTAGAGCCACACACAACTTTTGAACTTATAAGTATTACGGCTAAAGTTATTTGCTGAAAATTTCAGTAAAATGTGTGAATGTTTCTTTATGTATTAACCTCATAGCAGTAAATGACTTGCTGTTGTTTAATTTTTCTAAGGCATCTTAATAGACTTCTGTTGAAAACTTCAGTGTTAACATTTTTATAGTTTGTACTAAATTTAACCGTGATATAAAAATGAATTTTATGCATAGATCAGAATTTTAAATTAAAGGTTTTTTCTTTAAA |
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