Retrocopy Name | IPO5P1 |
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Species | Rhinopithecus roxellana | |
Coordinates | chr16:57359819-57362949 UCSC | |
Strand | - | |
Parental Sequence | XM_030922030.1 | |
Parental seq. overlap | 2598 bp | |
Parental seq. overlap (%) | 44.8% | |
Genomic Region |
Intergenic |
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Retrocopy Summary | IPO5P1, located on chr16:57359819-57362949, is a retrocopy of the parental gene IPO5. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
Gene Name | IPO5 |
Full Name | N/A |
Also known as | IPO5 |
Coordinate | chr18:95096581-95145836 |
Strand | - |
Gene summary | N/A |
>IPO5P1 |
GCAGAGGAAATCTATGAAAATATCCCAGGTCTGTGTAAGACTACCTTCCTCTTAGATGCCGTCAGAAATAGAAGAGCAGGTTATGAGGTGAGACAAATGGCTGCCGCACTGCTACGACGGCTTTTGTCCTCTGGGTTTGAGGAGGTTTATCCAAATCTGTCTGCTGATGTTCAGAGGGATGTCAAGATTGAACTGATTCTGGCTGTTAAGTTAGAAACACATGCTAGCATGAGGAAAAAACTTTGTGATATTTTTGCAGTGCTGGCCAGGAATTTGATAGATGAGGATGGTACTAACCACTGGCCGGAAGGTCTGAAGTTTCTTATTGATTCAATCTACTCTAAAAATGTGGTTTTATGGGAAGTTGCACTTCACGTTTTCTGGCACTTTCCTGGGATTTTTGGGACCCAAGAGCGGCATGATTTGGATATCATCAAACGGTTGTTGGACCAGTGTATTCAAGATCAAGAACATCCAGCAATCAGGACATTATCCGCTAGAGCTGCAGCTGCATTTGTACTTGCTAATGAGAATAATATTGCTCTTTTCAAAGACTTTGCAGACTTGCTTCCTGGAATCTTACAGGCTGTGAATGACTCATGCTACCAGGATGATGATTCAGTGCTAGAATCCCTTGTCGAGATTGCAGATACCGTACCTAAGTACTTGGGTCCTTATTTAGAAGATACTCTACAGTTGAGTTTGAAGTTATGTGGAGACTCTAGGCTTAGTAATCTGCAGCGCCAGCTGGCCCTCGAAGTTATAGTGACCTTGTCTGAAACTGCCACTCCGATGttgaaaaaacatacaaatattattGCACAGGCAGTTCCTCATATATTAGCAATGATGGTTGATCTACAAGATGATGAGGACTGGGTAAATGCTGATGAAATGGAAGAAGATGATTTTGACAGCAATGCAGTTGCTGCGGAGAGTGCACTAGACAGACTGGCTTGTGGGCTTGGTGGAAAAGTTGTTTTACCAATGACCAAGGAGCATATCATGCAGATGCTTCAGAGCCCTGACTGGAAGTATCGACATGCTGGATTAATGGCCTTATCTGCCATTGGAGAAGGATGCCATCAACAAATGGAATCAATTCTAGATGAAACAGTTAACTccgttttgctttttcttcaggATCCTCATCCAAGGGTGAGGGCTGCAGCCTGTACTACACTCGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTAATTTCCAAAAGAAATTTCATGAAACAGTGATTGCAGCTCTGTTACGTACCATGGAAAATCAAGGTAATCAGCGTGTGCAATCACATGCAGCTtctgctcttattatttttattgaagacTGCCCCAAATCATTGCTAGTTCTATATTTGGATAGTATGGTGAAAAATCTACATTCCATCTTGGTGATTAAACTTCAAGAGTTGATTCGGAATGGAACTAAGTTGGCTTTGGAACAACTTGTGACAACCATTGCATCAGTTGCAGAtacaatagaagaaaaatttgtCCCATATTATGATATATTCATGCCCTCACTAAAGCACATCGTTGAGCTTGCTGTTCAGAAGGAACTTAAGCTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAGTGCATTAGCCATATTGGTCTTGCCGTTGGGAAGGAAAAATTTATGCAAGATGCATCAAATGTGATGCAGCTGTTGTTGAAGACACAATCAGACTTAAATAATATGGAAGATGATGACCCTCAGACCTCTTACATGGTTTCAGCATGGGCTAGAATGTGTAAAATTCTTGGAAAAGATTTTCAACAGTACCTTCCACTAGTTATCGAGCCTCTTATTAAGACTGCTTCAGCTAAACCTGATGTTGCTCTCTTAGACACACAGGATGTGGAGAATATGAGTGATGATGATGGCTGGCAATTTGTAAATCTTGGAGACCAGCAGAGTTTTGGAATTAAAACTTCAGGACTTGAAGCAAAAGCAACTGCTTGCCAAATGTTGGTTTACTATGCTAAGGAGTTAAGGGAAGGGTTTGTGGAATATACAGAACAAGTTGTGAAGCTGATGGTTCCTTTactgaaattttatttccatgACAATGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAGTCCATGCCTTTTCTCCTGGAATGTGCAAGAATTCGTGGCCCAGAGTATCTTGCACAGATGTGGCAATTCATATGTGACCCCTTAATCAAGGCTATTGGTACTGAACCGGATACAGATGTGCTCTCGGAAATAATGAATTCTTTTGCAAAGTCCATTGAAGTTATGGGAGATGGTTGCCTTAATGATGAACACTTGGAAGAACTGGGAGGAATACTGAAAGCAAAACTTGAAGGGCACTTTAAAAACCAAGAATTGAGACAGGttaaaagacaggaagaaaactaTGATCAACAGGTTGAGATGTCTCTGCAAGATGAGGATGAATGTGATGTTTATATTCTGACCAAAGTATCAGATATTTTGCACTCATTATTTAGTACTTATAGGGAAAAGATTTTACCATGGTTTGAACAACTACTTCCATTAATTGTAAATCTAATTTGTTCAAGTAGACCATGGCCAGACAGACAGTGGGGATTGTGCATATTTGATGACATCATAGAGCACTGCAGTCCAACTTCATTTAAATATGTAGAATATTTTCGGTGGCCAATGCTACTAAATATGCGAGATAACAACCCTGAAGTCAGGCAAGCTGCTGCTTATGGCCTGGGTGTCATGGCACAGTTTGGTGGAGATGATTATCGTTCTTTATGTTCAGAAGCTGTTCCACTGCTGGTAAAAGTTATTAAGTGTGCAAattccaaaaccaaaaaaaatgtcATTGCTACAGAGAACTGTATCTCAGCAATAGGGAAGATTTTGAAGTTTAAGCCTAACTGTGTAAATGTAGATGAAGTTCTTCCACACTGGTTATCATGGCTTCCACTGCATGAAGATAAAGAGGAAGCTATTCAGACTTTGAGTTTTCTCTGTGACCTAATTGAAAGTAACCACCCAGTTGTAATTGGCCCAAATAATTCCAATCTTCCCAAAATAATCAGTATAATTGCAGAAGGAAAAATTAATGAGACTATTAACTATGAAGATCCTTGTGCCAAACGTCTAGCTAATGTCGTGCGTCAGGTACAGACTTCTGA |
>XM_030922030.1 |
GCGAGCGCGCCTCACGGCTCctgtctcccctccctccttctctctcacgCCTAGCGCAATGGCGGCGGCCGCGGCGGAGCAGCAACAGTTCTACCTGCTCCTGGGAAACCTGCTCAGCCCCGACAATGTGGTCCGGAAACAGGCAGAGGAAACCTATGAGAATATCCCAGGCCAGTCAAAGATCACATTCCTCTTACAAGCCATCAGAAATACAACAGCTGCTGAAGAGGCTAGACAAATGGCCGCCGTTCTCCTAAGACGTCTCTTGTCCTCTGCATTTGATGAAGTCTATCCAACACTTCCCTCTGATGTTCAGACTGCCATCAAGAGTGAGCTACTCATGATTATTCAGATGGAAACACAATCTAGCATGAGGAAAAAAGTTTGTGATATTGCGGCAGAACTGGCCAGGAATTTAATAGATGAAGATGGCAATAACCAGTGGCCTGAAGGTTTGAAGTTCCTTTTTGATTCAGTCAGCTCTCAAAATGTGGGACTGCGGGAAGCTGCCCTTCACATTTTCTGGAACTTCCCTGGAATTTTTGGGAACCAGCAGCAGCACTATTTAGACGTCATCAAACGGATGTTAGTTCAGTGTATGCAAGATCAGGAACACCCGTCGaTTAGAACTTTATCTGCTAGAGCTACAGCTGCATTTATACTTGCAAATGAGCATAATGTTGCTCTGTTCAAACATTTTGCAGACTTGCTACCAGGATTTCTACAGGCTGTAAATGACTCGTGCTACCAGAATGATGATTCTGTCCTAAAATCTCTTGTTGAGATTGCAGATACTGTTCCAAAGTATTTGCGTCCTCACTTGGAAGCAACTCTACAGCTAAGTCTAAAGTTGTGTGGAGACACTAGCCTCAACAATATGCAACGCCAGCTTGCCCTTGAAGTGATTGTCACCCTCTCCGAGACTGCAGCTGCTATGTTAAGAAAACATACCAATATTGTTGCACAGACTATTCCTCAGATGTTAGCAATGATGGTTGATTTGGAAGAAGATGAGGACTGGGCAAATGCAGATGAACTAGAAGATGATGATTTTGACAGcAATGCAGTTGCAGGCGAGAGTGCTCTAGACCGAATGGCTTGTGGACTTGGTGGAAAGCTCGTTCTGCCGATGATCAAGGAACACATTATGCAAATGCTTCAAAATCctgACTGGAAATACCGGCATGCAGGATTGATGGCCTTATCTGCCATTGGTGAAGGGTGCCACCAGCAAATGGAAGGAATTCTAAATGAGATagtaaattttgttttactttttcttcaggATCCTCATCCAAGAGTGAGGTATGCAGCCTGTAATGCCGTGGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTGGTTTCCAAAAGAAATTTCATGAGAAGGTGATTGCAGCTCTGCTGCAGACCATGGAAGACCAAGGCAATCAACGTGTACAGGCCCATGCAGCTGCTGCCCTCATTAACTTTACTGAAGACTGTCCCAAGTCACTACTTATTCCATACTTGGATAATTTGGTGAAACATCTGCATTCCATTATGGTACTTAAGCTTCAAGAGCTGATTCAGAAAGGCACCAAGTTAGTTTTGGAACAAGTTGTGACATCCATTGCGTCAGTTGCAGatactgcagaagaaaaatttgtCCCCTACTATGATTTATTTATGCCATCACTGAAGCACATCGTTGAGAATGCGGTTCAAAAAGAACTGAGACTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAATGCATTAGCCTCATTGGTCTGGCTGTTGGGAAGGAAAAATTCATGCAGGATGCATCAGATGTGATGCAGCTGTTGTTAAAGACCCAGACAGACTTCAATGACATGGAAGATGATGATCCTCAGATCTCTTACATGATCTCAGCATGGGCCAGAATGTGCAAAATCCTTGGAAAAGAATTTCAGCAGTACCTTCCAGTGGTTATGGGGCCTTTAATGAAGACGGCTTCAATTAAGCCCGAAGTAGCCCTTTTAGATACCCAAGACATGGAGAATATGAGTGATGATGATGGTTGGGAATTTGTGAACCTTGGAGATCAGCAAAGCTTTGGTATTAAAACTGCAGGACTAGAAGAAAAATCAACTGCTTGCCAGATGTTGGTTTGCTATGCTAAGGAGTTAAAGGAAGGCTTTGTGGAGTACACCGAACAGGTTGTCAAACTGATGGTCCCTTTACTGAAGTTTTATTTCCACGATGGTGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAATCCATGCCTCTTCTCCTGGAGTGTGCAAGAGTCCGTGGTCCTGAGTATCTCACACAGATGTGGCATTTTATGTGTGATGCTCTAATTAAGGCCATTGGTACAGAACCAGATTCAGACGTCCTCTCAGAAATAATGCATTCTTTTGCAAAgTGCATTGAAGTAATGGGAGATGGATGCCTTAATAATGAACACTTTGAAGAACTGGGAGGTATATTGAAAGCAAAGCttgaagaacattttaaaaatcaagaattaCGACAAGTTAAAAGACAAGATGAAGACTATGATGAACAGGTCGAAGAGTCACTACAAGATGAGgatgatAATGATGTTTATATTCTGACCAAAGTGTCAGATATTTTACATTCAATATTCAGTAGCTACAAAGAAAAGGTATTACCATGGTTTGAACAGCTGCTTCCATTAATTGTCAACCTCATTTGTCCACATAGACCATGGCCAGACAGACAATGGGGATTATGCATCTTTGATGATGTCATAGAACACTGTAGTCCAGCCTCATTTAAATATGCAGAATATTTCTTAAGACCAATGCTCCAATATGTATGTGACAACAGCCCAGAAGTCAGGCAAGCAGCTGCATATGGCCTGGGAGTCATGGCACAGTATGGTGGAGATAATTATCGCCCTTTTTGTACAGAAGCACTTCCCCTCCTGGTAAGAGTTATTCAGTCTGCGGATTCTAAGACCAAAGAAAATGTCAATGCTACAGAGAACTGCATCTCAGCAGTAGGGAAAATCATGAAGTTCAAGCCTGACTGTGTAAATGTTGAAGAGGTCCTTCCACACTGGTTGTCTTGGCTTCCACTACATGAAGATAAAGAAGAAGCTGTTCAGACTTTCAATTATCTGTGTGACCTGATTGAAAGTAATCATCCAATTGTTCTTGGCCCAAACAATACCAATCTGCCCAAAATATTTAGTATAATTGCGGAAGGAGAAATGCACGAGGCAATTAAACATGAAGATCCTTGTGCCAAACGTCTGGCCAATGTCGTTCGCCAAGTACAGACTTCTGGAGGATTGTGGACTGAGTGCATAGCACAGCTCAGTCCTGAGCAGCAGGCCGCCATTCAGGAGCTCCTGAACTCTGCGTGAAGGCCCTTAATGTCACCCACCAGAAAACTAACTACAAATAAACGCTTACCCTTTCGTTtaggtttctttgttttgtttttgagcaaAAGAGAGCGGTAGTGTTGTGTGTAGGCCATTTTGGAGAGCCATGAGCAGGAAGAGCAGCGCTGTGTTGCAGAATGGAGTTTCCATGGATTTCTACCAGACCAGTGAAGGAGTTCCTGGAAGCCCTGCAGTAGCACTGAAGAGTATTTTTCTATTGGTATAACCCACCCACctgaaggggaaagggaaatcaaattaatttttctcGTTAGACATAAGGAAATTTAAGGAAAAACAGCTTTAAGAACAGTTACTCAGCGCAGATGTGTGTTCACACAGATTGCTCTGCACTCAGTGTTCATTGTTAATTGGCGTGTGAGTCTTTCTGTAGGGTAGAAAGAAGCCTACTACCCAACAAACCAGTAGACCCAAACGTTGAAAAAAACTGATGACAGACAACAAGCATGAAGATGGCATATTTGATGTCACTTTGGTtctttttcccagaaggcttatACAGTGACTCAGTTGGGAAGCTTTCCAGCTTCCAGCCCTTGAATGTGAAGTGTCATTGGCATGTCTGGCAGTAGTCTCTTATTCACTCCTCAATAAACAACATTGAATACAAAAGAGGCTTGTGTAAAAACTCAGTACTGTCTGGCTTGGattcatttcatgtttttaatataagaatgatctaatatttttttaaagtaatagctATCAGTAATAGCTGAGTGTTTTTTCCCCTAATATTTTCCTTGTGCAATTCAGACTTAAGCATCGAGTTTTTACCATCTTCCACTGTAAGCTAAGTTATGATACCTATTCCATTCACAATTGGTGTTCTTTTTAAGGTTTGCAAATTCCAACCAATTTTGTAGCTAGGATTGTTCTGATTAGCTCAAAAAGATTTGGCTTAGTGTTTTCATTGCAAATTATAATTGCTGTAGAGCCACACACAACTTTTGAACTTATAAGTATTATGGCTAAAGTTATTTGCTGAAAATTTCAGTAAAATGTGTGAATGTTTCTTTATGTATTAACCTCATAGCAGTAAATGACTTgctgttgtttaatttttctaaggCATCTTAATAGACTTCTGTTGAAAACTTCAgtgttaacatttttatagtttgtACTAAATTTAACcgtgatataaaaatgaattttatgcatagatcagaattttaaattaaaggttttttctttaaatgatttGTATTACTTTATTAAAACTAAATCTGAAATGGAATAGAAAATGGAATGGATTACATACAGATGGTTTACTTGTTAGCAGATGcccttcaaatatattttccgtTTGCAGCACAACACCATTGCCTGGAGGTTTCCGAATCtagcaaaacaaaatattaaatgactTCACCTGCGCAGTCCTTGGTTTCACTGGATGGATACCTGTGGGCTCTTGTAATGTGTGTGGTAATATTTGGAACTTTATAGCCTGTATTTCTTGGGAGAAAAAGATGGGAATTGGAGTAAAAAATGTGTCAAGACAACCCATTTCTGCTTTCTTGTGTAGCATCTGCAAAGCCAATTCATGTACTGATGCCAGTCAGCTAGAGCaatgtaggtttttaaaatttaaattatgact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