Retrocopy Name | IPO5P1 |
|
Species | Tursiops truncatus | |
Coordinates | chr6:59548052-59551196 UCSC | |
Strand | + | |
Parental Sequence | XM_019921112.2 | |
Parental seq. overlap | 2602 bp | |
Parental seq. overlap (%) | 56.5% | |
Genomic Region |
Intergenic |
|
Retrocopy Summary | IPO5P1, located on chr6:59548052-59551196, is a retrocopy of the parental gene IPO5. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
Gene Name | IPO5 |
Full Name | N/A |
Also known as | - |
Coordinate | chr18:65866627-65907723 |
Strand | + |
Gene summary | N/A |
>IPO5P1 |
ATGGTGCGGAGACAAGCAGAGGAAATCTATGAAAATATCCCAGGTCTGTGTAAGACTACATTCCTCTTAGATGCCGTCAGAAATAGAAGAGCAGGTTATGAGGTGAGACAAATGGCTGCCGCCCTGCTACGACGGCTTTTGTCCTCTGGGTTTGAGGAAGTCTATCCAAATCTGCCTTCTGATGTTCAGAGGGACGTCAAGATTGAACTGATACTGGCTGTTAAGTTAGAAACCCATGCTAGTATGAGGAAAAAACTTTGTGATATTTTTGCAGTGCTGGCCAGGAATTTGATAGATGAGGATGGCACTAACCACTGGCCCGAAGGTCTGAAGTTCCTTGTTGATTCAATCTACTCTAAAAATGTGGTTCTGTGGGAAGTTGCACTTCACGTTTTCTGGCACTTTCCTGGGATTTTTGGGACCCAAGATCGGCACGATTTGGATATCATCAAACGGTTGTTGGACCAGTGTATTCAAGATCAAGAACATCCAGCAATCAGGACATTATCTGCTAGAGCTGCAGCTGCATTTGTACTTGCTAATGAGAATAATATTGCTCTTTTCAAAGACTTTGCAGACTTGCTTCCTGGAATCTTACAGGCTGTGAATGATTCATGCTACCAGGATGATGATTCAGTGCTAGAATCCCTTGTTGAGATTGCAGATACTGTACCTAAATATTTGGGTCCTTATTTAGAAGATACTCTGCAATTGAGTCTAAAGTTATGTGGAGACTCTAGACTTAGTAATCTGCAACGCCAGCTGGCTCTTGAAGTAATAGTGACCTTGTCTGAAACTGCAACCCCAATGttgaaaaaacatacaaatattatTGCACAGGCAGTTCCTCATATATTGGCAATGATGGTCGATCTACAAGATGATGAGGACTGGGTAAATGCTGATGAAATGGAAGAAGATGATTTTGACAGCAATGCAGTTGCTGCTGAGAGTGCACTAGACAGACTGGCTTGTGGGCTCGGTGGAAAACTTGTTTTACCAATGACTAAGGAGCATATCATGCAGATGCTTCAGAGCCCTGACTGGAAATATCGACATGCTGGATTAATGGCCTTATCTGCTATTGGAGAAGGATGCCATCAGCAAATGGAATCAATTCTAGACGAAACAGTTAactctgttttgctttttcttcaggATCCTCATCCAAGGGTGAGGGCTGCAGCCTGTACTACACTTGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTAACTTCCAAAAGAAATTCCATGAAACGGTGATTGCAGCTCTGTTGCGTACCATGGAAAATCAAGGTAATCAGCGTGTGCAGTCACATGCAGCTTCTGcgcttattatttttattgaagacTGCCCCAAATCATTGCTAGTTCTATATTTGGATAGTATGGTGAGAAATCTACATTCCATCTTGGTGATTAAACTTCAAGAGTTGATTCGCAATGGAACTAAGTTGGCCTTGGAACAGCTTGTGACAGCCATTGCCTCAGTTGCAGAtacaatagaagaaaaatttgtTCCATACTATGATATATTTATGCCCTCACTAAAGCAGATTGTTGAGCTTGCTGTTCAAAAGGAACTCAAACTTCTGAAAGGAAAAACTATTGAATGCATTAGCCATGTTGGTCTTGCTGTTGGGAAGGAAAAATTTATGCAAGATGCATCAAATGTGATGCAACTGTTGTTAAAAACACAATCAGACTTAAATAATATGGAAGATGATGACCCTCAGACCTCTTACATCATTTCAGCGTGGGCCAGAATGTGTAAAATTCTTGGAAATGATTTTCAACAGTACCTTCCACTGGTTATTGAGCCTCTTATTAAGACTGCTTCAGCTAAACCTGACGTTGCTCTCTTAGACACACAAGATGTGGAGAATATGAGTGATGATGATGGATGGCAATTTGTAAATCTTGGAGACCAGCAGAGTTTTGGAATTAAGACTTCAGGGCTTGAAGCAAAAGCAACTGCTTGCCAGATGTTGGTTTATTATGCTAAGGAGTTAAGGGAAGGATTCGTGGAATACACAGAACAAGTTGTAAAACTGATGGTTCCtttactgaaattttatttccatgacaATGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAGTCCATGCCTTTTCTCCTGGAATGTGCAAGAATTCATGGCCCAGAGTATCTTGCACAGATGTGGCATTTCATATGTGATCCTTTAATCAAGGCTATTGGGACCGAACCTGATACAGATGTACTCTCAGAAATAATGAATTCTTTTGCAAAGTCCATTGAAGTAATGGGAGATGGGTGCCTCAATGATGAACAGTTggaagaactgggagaaataCTGAAAGCAAAACTTGAAGGGCACTTTAAAAACCAAGAACTGAGACAGGttaaaagacaggaagaaaactaTGACCAACAGGTTGAAATGTCTCTGCAAGATGAGGATGAATGTGATGTTTATATTCTGACCAAAGTATCAGATATTTTGCACTCATTATTTAGTACTTACAAGGAAAAGATTTTACCGTGGTTTGAACAGCTGCTTCCATTAATTGTAAATCTAATTTGTTCTAATAGGCCATGGCCAGACAGACAGTGGGGATTGTGCATATTTGATGATATCATAGAACACTGTAGTCCAACCTCATTTAAATATGTAGAATATTTTCGGTGGCCAATGCTACTAAATATGCGAGACAACAACCCTGAAGTCAGGCAAGCGGCTGCTTATGGCCTGGGTGTTATGGCACAGTTTGGTGGAGATGATTATCGTTCTTTATGTTCAGAAGCTGTTCCGCTGCTGGTAAAAGTTATTAAGTGTGCAAattccaaaaccaaaaaaaatgtcattgctaCAGAGAACTGTATCTCAGCAGTAGGCAAGATTTTGAGGTTTAAGCCTAACTGTGTAAATGTAGATGAAGTTCTTCCACACTGGTTGTCATGGCTTCCATTGCATGAGGATAAAGAGGAAGCTATTCAGACTTTGAATTTTCTCTGTGACTTAATTGAAAGTAACCACCCAGTTGTACTTGGTCCAAATAATTCCAATCTTCCAAAAATAATCAGTGTAATTgcagaaggaaaaatgaatgaGACTATTAACTATGAAGATCCTTGTGCCAAACGCCTAGCTAATGTCGTGCGTCAGGTACAGACTTCTG |
>XM_019921112.2 |
AGCGCGCCTCACGgctcctgtctcccctccctccttctctctctcacgCCTAGCGCAATGGCGGCCGGCGCGGCGGAGCAGCAACAGTTCTACCTACTCCTGGGAAACCTGCTCAGCCCCGACAATGTGGTCCGGAAACAGGCAGAGgaAACCTATGAGAATATCCCAGGCCAGTCGAAGATCACATTCCTTTTACAAGCCATCAGAAATACAACAGCTGCTGAGGAGGCTAGACAAATGGCTGCCGTTCTCCTAAGACGTCTTTTGTCCTCTGCATTTGATGAAGTCTATCCAACTCTTCCCACTGATGTTCAGACTGCCATCAAGAGTGAACTACTAATGATTATTCAAATGGAAACACAGTCTAGcatgaggaaaaaaatttgtGATATTGCTGCAGAGCTGGCCAGGAATTTGATAGatgAGGATGGCAACAACCAATGGCCTGAAGGTCTGAAGTTCCTTTTTGATTCAGTCAGCTCTCAAAATGTGGGACTGCGGGAAGCTGCCCTTCATATTTTCTGGAACTTTCCTGGAATTTTTGGAAATCaacagcagcactatttagacGTCATCAAACGGATGTTAGTTCAGTGTATGCAAGATCAGGAACATCCATCGATCAGGACATTATCTGCTAGAGCTACCGCTGCATTTATACTTGCAAACGAACATAATGTTGCCCTGTTCAAACATTTTGCAGACTTGTTACCCGGATTcttacagGCTGTAAATGACTCATGCTACCAGAATGATGATTCGGTCCTAAAATCCCTTGTTGAGATTGCGGACACTGTTCCAAAGTATTTACGTCCTCATTTGGAAGCAACTTTACAGCTAAGTCTGAAGTTGTGTGGAGACACCAGCCTCAATAATATGCAACGCCAGCTTGCCCTTGAAGTAATTGTGACCCTCTCTGAGACTGCAGCTGCTATGTTAAGAAAACATACCAATATTGTTGCACAGACTAttccTCAGATGTTAGCCATGATGGTGGACCTTGAAGAGGATGAGGACTGGGCAAATGCGGACGAACTAGAAGATGATGATTTTGACAGCAATGCGGTTGCTGGTGAGAGTGCTTTAGACCGAATGGCTTGTGGACTTGGTGGAAAGCTCGTCCTGCCGATGATCAAGGAACATATTATGCAGATGCTTCAGAATCCTGACTGGAAGTATCGGCATGCAGGATTAATGGCCTTATCTGCCATTGGGGAAGGATGCCACCAGCAAATGGAAGGAATTCTAAATGAGATagtaaattttgttttgctttttcttcaagATCCTCATCCCAGAGTGAGGTATGCAGCCTGTAATGCCGTGGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTGGTTTCCAAAAGAAATTCCATGAGAAGGTGATTGCAGCTCTGCTGCAGACCATGGAAGACCAGGGCAATCAGCGTGTACAGGCCCATGCCGCTGCCGCTCTCATTAACTTCACCGAAGACTGTCCCAAGTCACTACTTATTCCATATTTAGATAATTTGGTGAAACATCTGCATTCCATCATGGTCCTTAAACTTCAAGAGTTGATTCAGAAAGGCACCAAGTTAGTTTTGGAACAAGTTGTGACGTCTATCGCATCAGTTGCAGATACTGCAGAAGAAAAAtttgtcccctactatgacttaTTTATGCCATCACTGAAGCACATTGTTGAGAATGCAGTTCAAAAGGAGCTCAGACTTCTCAGAGGAAAAACTATTGAATGCATCAGCCTCATTGGTCTGGCTGTTGGGAAGGAAAAAttcATGCAAGACGCATCAGATGTGATGCAGCTATTATTGAAGACGCAGACAGACTTCAGTGATATGGAAGATGATGACCCTCAGATCTCTTACATGATCTCAGCATGGGCCAGAATGTGCAAAATCCTTGGGAAGGAATTTCAGCAGTACCTTCCAGTGGTCATGGGACCGCTACTGAAGACGGCTTCGATTAAGCCTGAAGTGGCCCTTTTAGATACCCAAGACATGGAGAACATGAGTGATGATGATGGTTGGGAATTTGTGAACCTTGGAGATCAGCAAAGTTTTGGTATTAAAACTGCAGGACTGGAAGAAAAGTCAACTGCTTGTCAGATGCTGGTTTGCTATGCTAAGGAATTAAAAGAAGGCTTTGTGGAGTACACGGAACAGGTTGTGAAACTCATGGTCCCTCtactgaaattttatttccatgatGGTGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAATCCATGCCTCTTCTCCTGGAATGTGCAAGAGTTCGTGGTCCTGAGTATCTCACACAGATGTGGCATTTTATGTGTGATGCTCTAATCAAGGCCATTGGCACAGAACCAGATTCAGATGTCCTCTCAGAAATAATGCACTCTTTTGCaaagTGCATTGAAGTCATGGGAGATGGATGCCTTAATAATGAACACTTTGAAGAGTTGGGAGGTATATTGAAAGCTAAACttgaagaacattttaaaaatcaagaattgCGACAAGTTAAAAGACAAGATGAAGACTATGATGAACAGGTGGAAGAATCACTACAAGATGAGgatGATAATGATGTTTATATTCTGACCAAAGTGTCAGACATTTTACACTCAATATTCAGTAGCTACAAGGAAAAAGTGTTACCATGGTTTGAACAGCTGCTTCCGTTAATTGTCAACCTAATTTGTCTACATAGACCGTGGCCAGATAGACAGTGGGGCTTGTGCATCTTTGATGATGTCATAGAACACTGTAGTCCAGCCTCATTTAAATATGCAGAATATTTCATAAGGCCAATGCTCCAATACACATGTGACAGCAGCCCAGAAGTCAGGCAAGCAGCTGCGTATGGCCTGGGAGTCATGGCACAGTACGGCGGAGACAACTATCGTCCTTTTTGTACAGAAGCACTTCCACTGCTGGTAAGAGTTATTCAGTCTGCTGATTCTAAGACCAAAGAAAATATCAATGCTACAGAGAACTGCATCTCGGCAGTAGGGAAAATTATGAAGTTCAAGCCTGATTGTGTGAACGTTGAAGAAGTTCTCCCACATTGGCTGTCTTGGCTTCCACTACATGAGGATAAAGAAGAAGCTGTTCAGACTTTCAATTATCTTTGCGACCTGATTGAAAGtaatCACCCAATCGTTCTTGGCCCTAACAATACCAATCTGCCCAAAATATTCAGTATAATTGCAGAAGGAGAAATGCATGAGGCAATTAAACATGAAGATCCCTGTGCCAAACGTCTGGCTAATGTAGTTCGCCAAGTACAGACTTCTGGAGGACTGTGGACTGAATGCATAGCACAGCTCAGTCCCGAGCAGCAGGCAGCCATACAGGAGCTCCTGAACTCTGCCTGAAGGGCCTTAATatcaccaccagaaaactaactCCAAATAAACGTTTACCCTTTTGTttaggtttctttgttttgtttttgagcaaAAGAGAACGGTAGAGTTGTGTGTAGGCCATTCTTCTGCAAAGCCACAACAGCAGGAAGAGAAGCCCTGGGTTTCAGGATGGTGTTTAAGTGGATTTCTCCCACACCACTGAGGAAGTCCCATGAGCCCTGCAGTAGCACTGAAGAGTATTTTTCTATTGGTATAACCCACCCATGTGAAGGtgaaagggaaattaaatttTCTCACTAGATATAAGGAGATTTAAGACAAAACAGCTTTAAGATCAGTTCCTCAACATTAGATGTGTGTTGAAACAAGTTGCTGTACACCTAGTGTTAATTCTATTAATTGGAGTGTGAGTCTTTCTGTACGGTAGAAAGAAGCCTTTTACCCAGCAAACTAGTAGatccaaaaattgaaaaaaagctGAAGACAAAAACAACAAGCATGAAGATGTTATTTTATGTCACTTTCGATTCTTTTCCCCAAAAGGCTTATGCAGTGACTCAGTTTGGAAAGCTTTTCAGCTTCCAGCCCTTGAATGTGAAGTGTCGTTGGCATGTCTGGCAGTAGTCTCATTCACTCCTCAATAAACAACGTTGAAATACGAAAGAAGTTTGTGTAAAAATTTAGTACTGTCTGGCTTTgattcatttaatgtttttaatataagaataatctagtattttttaaaggaataaggATGGCTCTGAATTTTGTTTCCCCCTGATATTTTCCTCGTGCAATTCAAAGTTAAAAGCATCTAGTTTTTACCATCTTCCACTTTAATTTAAACTAAGTTATGATACACCCACTCTGTTCACAATTGGTGTGCAGACTTCAGTCGTTTTAAAGCTAGCATTGTTCCTGTTAGAAAAAAAGACTTGGCTTAGTATTTTTATTGCAAATTGTAATTGCTGTGGAGCCACAtgcaacttttaattttatgataaGTATTATGGCTAAAATTATTTACTGATAAATTCAGTAAAAtgtgtgaatgtgtttttctttatgtattaacCTCATAGCAGTAAATGACTTGCtgttgtttctttaaataatttttctaagaGGTCTTATTAGATTTCTGTTGAAACTCcagtgttaacatttttatagtttGTACTGAATTTAACCGtgatacaaaaatgaattttatgcctagatcagaatttaaaattaaaggttttttctttaaa |
PMID - Link | Title |
---|