| Retrocopy Name | IPO5P1 |
|
| Species | Callithrix jacchus | |
| Coordinates | chr1:110740911-110743828 UCSC | |
| Strand | - | |
| Parental Sequence | XM_035292898.1 | |
| Parental seq. overlap | 2429 bp | |
| Parental seq. overlap (%) | 50.3% | |
| Genomic Region |
Intergenic |
|
| Retrocopy Summary | IPO5P1, located on chr1:110740911-110743828, is a retrocopy of the parental gene IPO5. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
| Gene Name | IPO5 |
| Full Name | N/A |
| Also known as | - |
| Coordinate | chr1:12958990-13023827 |
| Strand | + |
| Gene summary | N/A |
| >IPO5P1 |
| GAAACACATGCTAGCATGAGGAAAAAACTTTGTGATATTTTTGCAGTGCTGGCCAGGAATTTGATAGATGAGGATGGCACTAACCACTGGCCGGAGGGTCTGAAGTTTCTTATTGATTCAATCTACTCTAAAAATGTGGTTCTATGGGAAGTTGCACTTCACGTTTTCTGGCACTTTCCTGGGATTTTCGGGACCCAAGAGCGGCATGATTTGGATATCATCAAACGGTTGTTGGACCAATGTATTCAAGATCAAGAACATCCAGCAATCAGGACATTATCCGCTAGAGCTGCAGCTGCATTTGTACTTGCTAATGAGAATAATATTGCTCTTTTCAAAGAGTTTGCAGACTTGCTTCCTGGAATCTTACAGGCTGTGAATGACTCATGCTACCAGGATGATGATTCAGTGCTAGAATCGCTTGTTGAGATTGCAGATACAGTACCTAAGTACTTGGGTCCTTATTTAGAAGATACTCTACAGTTGAGTTTGAAGTTATGTGGAGACTCTAGGCTTAGTAATCTGCAGCGCCAGCTGGCCCTAGAAGTTATAGTGACCTTGTCTGAAACTGCCACTCCAATGttgaaaaaacatacaaatattattGCACAGGCAGTTCCTCATATATTAGCAATGATGGTTGATCTACAAGATGATGAGGACTGGGTAAATGCTGATGAAATGGAAGAAGATGATTTTGACAGCAATGCAGTTGCTGCTGAGAGTGCACTAGACAGACTGGCTTGTGGGCTTGGTGGAAAAGTTGTTTTACCAATGACCAAGGAGCATATCATGCAGATGCTTCAGAGCCCTGACTGGAAATACCGACATGCCGGATTAATGGCCTTATCTGCCATTGGAGAAGGATGCCATCAACAAATGGAATCAATACTAGATGAAACAGTTAACTccgttttgctttttcttcaggATCCTCATCCAAGGGTGAGGGCTGCAGCCTGTACTACACTTGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCtaatttccaaaagaaatttCATGAAACAGTGATTGCAGCTCTGTTACGTACCATGGAAAATCAAGGTAATCAGCGTGTGCAATCACATGCAGCTtctgctcttattatttttattgaagacTGCCCCAAATCATTGCTAGTTCTGTATTTGGATAGTATGGTGAAAAATCTACATTCCATCTTGGTGATTAAACTTCAAGAGTTGATTCGGAATGGAACTAAGTTGGCCTTGGAACAACTTATAACAACCATTGCATCAGTTGCAGAtacaatagaagaaaaatttgtCCCATATTATGATATATTCATGCCCTCACTAAAGCACATCGTTGAGCTTGCTGTTCAGAAGGACCTCAAGCTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAGTGCATTAGCCATATTGGTCTTGCTGTTGGGAAGGAAAAATTTATGCAAGATGCATCAAATGTGATGCAGCTGTTGTTGAAGACACAAACAGACTTAAATAATATGGAAGATGATGATCCTCAGACCTCTTACATGGTTTCAGCATGGGCTAGAATGTGTAAAATTCTTGGGAAAGATTTTCAACAGTACCTTCCACTGGTTATTGAGCCTCTTATTAAGACTGCTTCAGCTAAACCTGATGTTGCTCTCTTAGACACACAGGATGTGGAGAATATGAGTGATGATGATGGCTGGCAATTTGTAAATCTTGGAGACCAGCAGAGTTTTGGAATTAAAACTTCAGGACTTGAAGCAAAAGCAACTGCTTGCCAGATGTTGGTTTACTATGCAAAGGAGTTAAGGGAAGGGTTTGTGGAATATACAGAACAAGTTGTGAAGCTGATGGTTCctttactgaaattttatttccatgaCAATGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAGTCCATGCCTTTTCTCCTGGAATGTGCAAGAATTCGTGGCCCAGAGTATCTTGCACAGATGTGGCAATTCATATGTGACCCCTTAATTAAGGCTATTGGTACTGAACCGGATACAGATGTGCTCTCAGAAATAATGAATTCTTTTGCAAAGTGCATTGAAGTTATGGGAGATGGCTGCCTTAATGATGAACACCTGGAAGAACTGGGAGGAATACTGAAAGCAAAACTTGAAGGGCACTTTAAAAACCAAGAATTGAGACAGGttaaaagacaggaagaaaactaTGATCAACAGGTTGAGATGTCTCTGCAAGATGAGGATGAATGTGATGTTTATATTCTGACCAAAGTATCAGATATTTTGCACTCATTATTTAGTACTTATAAGGAAAAGATTTTACCATGGTTTGAACAACTATTGCCATTAATTGTAAATCTAATTTGTTCAAGTAGGCCATGGCCAGACAGACAGTGGGGATTGTGTATATTTGATGACATCATAGAGCACTGCAGTCCAACTTCATTTAAATATGTAGAATATTTTCGGTGGCCAATGCTACTAAATATGCGAGATAACAACCCTGAAGTCAGGCAAGCTGCTGCTTATGGCCTGGGTGTAATGGCACAGTTTGGTGGAGATGATTATCGTTCTTTATGTTCAGAAGCTGTTCCACTGCTGGTAAAAGTTATTAAGTGTGCCAattccaaaaccaaaaaaaatgtcATTGCTACAGAGAACTGTATCTCAGCAATAGGGAAGATTTTGAAATTTAAGCCTAATTGTGTAAATGTAGATGAAGTTCTTCCACACTGGTTATCATGGCTTCCACTCCATGAAGATAAAGAGGAAGCTATTCAGACTTTCAGTTTTCTCTGTGACCTAATTGAAAGTAACCACCCAGTTGTAATTGGTCCAAATAATTCCAATCTTCCCAAAATAATCAGTATAATTGCGGAAGGAAAAATTAACGAGACTATTAACTATGAAGATCCTTGTGCCAAACGCCTAGCTAATGTTGTGCGTCAGGTACAGACTTCTGA |
| >XM_035292898.1 |
| TGTCATCCCACAATGATGGACCAGCCATAGTGCAGAGAACAGCTCTGACTGCAGTTAAGTCATCCCAAAACCTCACATCCAGGTGGTTCCAGGGAGAAGCCTTTCCAGGACCCATGTGTAGTCACAGCAGTTTTCCCTGATCAGCATCCTTGCAGCACTCAACAGAGGAAAGAAATTCCTAACCAAGGAATGCTGCTCAGAAAGTACTGTACCATGTTTCCAAATCCCTGAGGATCAAGTTGGAAAACTGGAAGCAACAGAAAACACAATAAGCGCAATGGCGGCGGCCGCGGCGGAGCAGCAACAGTTCTACCTGCTCCTGGGAAACCTGCTCAGCCCCGACAATGTGGTCCGGAAACAGGCAGAGgaaaCCTATGAGAATATCCCAGGCCAGTCAAAGATCACATTCCTCTTACAAGCCATCAGAAATACGACAGCTGCTGAAGAGGCTAGACAAATGGCTGCTGTTCTCCTAAGACGTCTCTTGTCCTCTGCATTTGATGAAATTTATCCAACACTTCCCTCTGATGTTCAGACTGCCATCAAGAGTGAGCTACTCATGATTATTCAGGTGGAAACACAATCTAGCATGAGGAAAAAAATTTGTGATATTGCTGCAGAACTGGCCAGGAATTTAATAGATGAGGATGGCAACAACCAGTGGCCTGAAGGTTTGAAGTTCCTTTTTGATTCCGTTAGCTCTCAGAATGTGGGACTTCGGGAAGCTGCCCTTCACATTTTCTGGAACTTCCCTGGAATTTTTGGGAACCAGCAGCAGCACTATTTAGATGTCATCAAACGGATGTTAGTTCAGTGTATGCAAGATCAGGAACACCCATCGatCAGGACATTATCTGCTAGAGCTACAGCTGCATTTATACTTGCAAATGAGCATAATGTTGCTCTGTTCAAACATTTTGCAGACTTGCTGCCGGGATTTCTACAGGCTGTAAATGACTCGTGCTACCAGAATGATGATTCTGTCCTAAAATCCCTAGTTGAGATCGCAGATACTGTTCCAAAGTATTTGCGTCCTCACTTGGAAGCGACTCTACAGCTAAGTCTAAAGTTGTGTGGAGATACTAGCCTCAACAATATGCAACGCCAGCTTGCCCTTGAAGTGATCGTCACCCTCTCTGAGACTGCAGCTGCTATGTTAAGAAAACATACCAATATTGTTGCACAGACTATTCCTCAGATGTTAGCAATGATGGTTGATTTGGAAGAAGATGAGGACTGGGCAAATGCGGATGAACTGGAAGATGATGATTTTGACAGCAATGCAGTTGCAGGTGAGAGTGCTCTAGACCGAATGGCTTGTGGACTTGGTGGAAAGCTTGTTCTGCCGATGATCAAGGAACACATTATGCAAATGCTTCAAAATCctgACTGGAAATACCGGCATGCAGGATTGATGGCCTTATCTGCCATTGGTGAAGGATGCCACCAGCAAATGGAAGGAATTCTAAATGAGATagtaaattttgttttactttttcttcaggATCCTCATCCAAGAGTAAGGTATGCAGCCTGTAATGCTGTGGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTGGTTTCCAAAAGAAATTTCATGAGAAGGTGATTGCAGCTCTGCTGCAGACCATGGAAGACCAAGGCAATCAACGGGTACAGGCCCATGCAGCTGCTGCCCTCATTAACTTTACTGAAGATTGTCCCAAGTCACTGCTTATTCCATACTTAGATAATTTGGTGAAACATCTGCATTCCATTATGGTACTTAAGCTTCAAGAGCTGATTCAGAAAGGCACCAAATTAGTTTTGGAACAAGTCGTGACATCCATTGCGTCAGTTGCAGATACTGCAGAAGAAAAATTTGTCCCCTACTACGATTTATTTATGCCATCCCTGAAGCACATCGTTGAGAATGCCGTTCAAAAAGAACTGAGACTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAGTGCATTAGCCTCATTGGTCTGGCTGTTGGGAAGGAAAAAttCATGCAGGATGCCTCAGATGTGATGCAATTATTGTTAAAGACCCAGACAGACTTCAATGATATGGAAGATGATGATCCTCAGATCTCTTACATGATCTCAGCATGGGCCAGAATGTGCAAAATCCTTGGAAAAGAATTTCAGCAGTACCTTCCAGTGGTTATGGGGCCTTTAATGAAGACGGCTTCAATTAAGCCTGAAGTAGCCCTTTTAGATACCCAAGACATGGAGAATATGAGTGATGATGACGGCTGGGAATTTGTGAACCTTGGAGATCAGCAAAGCTTTGGTATTAAAACTGCAGGATTAGAAGAAAAATCAACTGCTTGCCAGATGTTGGTTTGCTATGCTAAGGAGTTAAAGGAAGGCTTTGTGGAGTACACTGAGCAGGTTGTCAAACTGATGGTCCCTttgctgaaattttatttccatgaTGGTGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAATCCATGCCTCTTCTCCTGGAGTGTGCAAGAGTCCGTGGTCCTGAATATCTCACACAGATGTGGCATTTTATGTGTGATGCTCTAATTAAGGCCATTGGTACAGAACCAGATTCAGATGTCCTCTCAGAAATAATGCATTCTTTTGCAAAgTGCATTGAAGTAATGGGAGATGGATGCCTTAATAATGAACACTTTGAAGAACTGGGTGGTATATTGAAAGCAAAGcttgaagaacattttaaaaatcaagaattaCGACAAGTTAAAAGACAAGATGAAGACTATGATGAACAGGTTGAAGAGTCACTACAAGATGAGGATGAAAATGACGTTTATATTCTGACCAAAGTGTCAGATATTTTACACTCAATATTCAGTAGCTACAAGGAAAAGGTGTTACCGTGGTTTGAACAGCTGCTTCCATTAATTGTCAACCTCATTTGTCCACATAGACCATGGCCGGACAGACAATGGGGATTATGCATCTTTGATGATGTCATAGAACACTGTAGTCCAGCCTCATTTAAATATGCAGAATATTTCTTAAGACCAATGCTCCAATATGTATGCGATAACAGCCCAGAAGTCAGGCAAGCAGCTGCATATGGCCTGGGAGTCATGGCACAGTATGGTGGAGATAATTATCGCCCTTTTTGTACAGAAGCACTTCCCCTGCTGGTAAGAGTTATTCAGTCTGCTGATTCTAAGACCAAAGAAAATGTCAATGCTACCGAGAACTGCATCTCAGCAGTAGGGAAAATCATGAAGTTCAAGCCTGACTGTGTAAACGTTGAAGAGGTGCTGCCACACTGGTTGTCTTGGCTTCCACTACATGAAGATAAAGAAGAAGCTGTTCAGACTTTCAATTATCTGTGTGACCTGATTGAAAGTAATCATCCAATTGTTCTTGGCCCAAACAATACCAATCTGCCCAAAATATTCAGTATAATTGCGGAAGGAGAAATGCACGAGGCAATTAAGCACGAAGATCCTTGTGCCAAGCGTCTGGCCAATGTCGTCCGCCAAGTACAGACTTCTGGAGGACTGTGGACTGAGTGCATAGCACAGCTCAGTCCTGAGCAACAGGCCGCCATTCAGGAGCTCCTGAACTCTGCGTGAAGGGCCTTAATGTCACCCACCAGAAAACTAACTCCAAATAAACGTTTACCCTTTTGTTtaggtttctttgttttgtttttgagcaaAAGAGATTGGTAGTGTTGTGTGTAGGCCATTCTTCTGGAGAGCCACGAGCAGGAAGAGCAGTGCTGTGTTGCGGAACGGATTTCTACCAGAACACTGAAGGTGCTCCTGGGAAGCCCTGCAGTAGCATTCAAGAGTATTTTTCTATTGGTATAACCCACCCAtctgaaggggaaggggaaataaaattaatgtttcttgTTAGACATAAGGAAACTTAAGGAAAAACAGCTTTAAGAACAGTTACTCAGCGTAGATTTGTGTTCACACAAATTGCTCTACACCCAGTGTTCATTGTTAATTGGAGTGTGAGTCTTTCTGTAGGGTAGAAAGAAGCCTACTACCCAGCAAACCAGTAGAcccaaaagttgaaaaaaaaaactgatgacaTAAAACAAGCATGAAGATGGCATATTTGATGTCACTTTGGTTCTTTTTCCTGGAAGGCTTATACAGTGACTCAGTTGGGAAGCTTTCCAGCTTCCAGCCCTTGAATGTGAAGTGTCATTGGCATGTCTGGCAGTAGTCTCTCATTCACTCCTCAATAAACAACATTGAATGCAAAAGAGGCTTGTGTAAAAACTCAGTACTGTCTGTCTTGGAttcatttcatgtttttaatataagaatgattaatatttttttaaagggatagCTATCAGTAATAGCTAAGTGTTTTTTCCCCTAATATTTTCCTTGTGCAATTCAGACTTAAGCATCAAGTTTTTACCATCTTCCGCTGTAAGCTAAGTTATGATACCTATTCCATTCACAATTGGTGTCCTTTTTAAGGTTTGCAAAtttcaatcaattttttttttaagctaggaTTGTTCTGATTAGCTCAAAAAGATTTGGCTTTGTATTTCCATTGCAAAGTATAATTGCTATAGAGCCACACACAACTTGAACTTTTAATTATAAGTATTATGGCTAAAGATATTTACTGAAAATTTCAGTAAAATGTGtgaatggtttttttctttatgtattaacCTCATAGCAGTAAATGACTTgctgttgtttaatttttctaaggCATCTTAATAGACTTCTGTTGAAAACTTCAGTGTTAACGTTTTTATAGTTTGTACTAAATTTAACCgtgatataaaaatgaattttatgcatagatcagaattttaaattaaaggttttttctttaaa |
| PMID - Link | Title |
|---|
