| Retrocopy Name | IPO5P2 |
|
| Species | Choloepus didactylus | |
| Coordinates | chr10:54225785-54228918 UCSC | |
| Strand | - | |
| Parental Sequence | XM_037800250.1 | |
| Parental seq. overlap | 2611 bp | |
| Parental seq. overlap (%) | 65.3% | |
| Genomic Region |
Intergenic |
|
| Retrocopy Summary | IPO5P2, located on chr10:54225785-54228918, is a retrocopy of the parental gene IPO5. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
| Gene Name | IPO5 |
| Full Name | N/A |
| Also known as | IPO5 |
| Coordinate | chr12:38746014-38798360 |
| Strand | - |
| Gene summary | N/A |
| >IPO5P2 |
| CAGGCAGAGGAAATCTATGAAAATATCCCAGGCCTATGTAAGACTACATTCCTCTTAGATGTCGTCAGAAATAGAAGAGCAGGTTATGAGGTGAGACAAATGGCTGCCGCACTGCTACGAAGGCTTTTGTCCTCTGGTTTTGAGGAAGTCTATCCAAATCTACCTTCTGATGTTCAGAGGGATGTCAAGATTGAGCTGATACTGGCCGTTAAGTTAGAAACACATGCGAGCATGAGGAAAAAACTCTGTGATATTTTTGCGGTGCTGGCCAGGAATTTGATAGATGAAGATGGCACTAACCACTGGCCTGAAGGTCTAAAGTTCCTTATTGATTCAATCCACTCTAAAAATGTGGTTTTATGGGAAGTTGCACTTCATGTTTTCTGGCACTTTCCTGGGATTTTTGGGAACCAAGAGCGGCATAATTTGGATATCATCAAACGGTTGTTGGACCAGTGTATTCAAGATCAAGAACATCCAGGAATTAGGACATTATCTGCTAGAGCTGCAGCTGCATTTGTACTTGctaatgaaaataatattgctcttttcaaagactTTGCAGACTTGCTTCCTGGAATTTTACAGGCTGTGGATGACTCATGTTACCAGGATGATGATTCGGTCTTAGAATCCCTTGTTGAGATTGCAGATACTGTTCCTAAGTATTTGGGTCCTTATTTAGAGGATACTCTGCAGTTGAGTCTCAAGTTATGTGGAGACTCTAGGCTTAGTAATCTGCAACGCCAGCTGGCACTTGAAGTAATAGTGACCTTGTCTGAAACTGCAACTCCAATGCtgaaaaaacatacaaatattatTGCACAGGCAGTTCCTCATATATTAGCAATGATGGTTGATCTACAAGATGATGAGGACTGGGTTAATGCTGATGAAATGGAAGAAGATGATTTTGACAGCAATGCAGTAGCCGCTGAGAGTGCACTAGACAGACTGGCTTGTGGCCTTGGTGGAAAAGTTGTTTTACCAATGACCAAGGATCATGTAATGCAGATGCTTCAGAGCCCTGACTGGAAATATCGACATGCTGGATTAATGGCCTTATCTGCCATTGGAGAAGGATGCCATCAGCAAATGGAATCAACTCTAGATGAAATGGTTAActctgttttgctttttcttcaggATCCCCATCCAAGGGTAAGGGCTGCAGCCTGTACAACACTTGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTAGCTTCCAAAAGAAATTCCATGAAACAGTGATTGCAGCTTTGTTGCGTACCATGGAAAATCAAGGTAATCAGCGCGTGCAATCACATGCAGCTTCcgctcttattatttttattgaagatTGCCCCAAGTCATTGTTAGTTCTATATTTAGATAGCATGATGAAAAATCTACATTCTATCTTGGTGATTAAACTTCAAGAGTTGATTCGAAATGGAACTAAGCTGGCCTTGGAACAACTTGTGACAACCATTGCCTCAGTTGCAGAtacaatagaagaaaaatttgTTCTTTATTATGATCTATTTGTGCCCTCACTAAAGCACATTGTTGAGCTTGCTGTTCAGAAGGAACTCAAGCTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAATGTATTAGCCATGTTGGTCTTGCTGTTGGGAAGGAAAAATTTATGCAAGATGCATCAAATGTGATGCAGTTATTGCTGAAGACACAATCAGACTTAAATAATATGGAAGATGATGACCCTCAAATCTCTTATGTGGTTTCAGCATGGGCTAGAATGTGTAAAATTCTTGGAAAAGATTTTCAACAGTACCTTTCTCTGGTTATCGAACCTCTTATTAAGACTGCTTCAGCTAAACCTGATGTCGCTCTCTTAGACACACAAGATGTGGAGAATATGAGCGATGATGATGGCTGGCAATTTGTAAATCTTGGAGACCAGCAAAGTTTTGGAATTAAAACTTCAGGACTTGAAGCAAAAGCAACTGCTTGCCAGATGTTGGTTTACTATGCCAAGGAGTTAAGGGAAGGATTTGTGGAATATACGGAACAAGTCGTAAAGCTAATGGTTCctttactgaaattttatttccatgatAATGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAGTCTATGCCTTTTCTCCTGGAATGTGCAAGAATTCATGGCGCAGACTATCTTGCACAGATGTGGCAGTTCATATGTGATCCTTTAATCAAGGCTATTGGAACTGAACCTGATACAGATGTACTCTCAGAAATAATGAATTCTTTTGCAAAGTCCATTGAAGTAATGGGAGATGGATGCCTTAATGAAGAACACTtggaagaattgggaggaataTTGAAAGCGAAACTTGAAGGGCACTTTAAAAACCAAGAATTGCGACAGGTTAAAAGACAGGAAGAAAACTATGATCAACAGGTTGAGATGTCTCTGCAAGATGAGGATGAATGTGATGTTTACATTCTGACCAAAGTATCAGATATTTTGCACTCATTATTTAGTACTTATAAGGAAAAGATTTTACCATGGTTTGAACAgctacttccattaattgtaaattTAATTTGTTCAAGTAGGCCATGGCCAGACAGACAGTGGGGATTGTGCATATTTGATGATATCATAGAGCACTGCAGTCCAACCTCATTTAAATATGTAGAATATTTTCGGTGGCCAATGCTACTAAATATGCGAGATAACAACCCTGAAGTCAGGCAAGCTGCTGCTTATGGCCTGGGAGTTATGGCACAGTTTGGTGGAGATGATTATCGTTCTTTATGTTCAGAAGCCATTCCACTGCTGGTAAAGGTTATTAAGTGTGCAAAttctaaaaccaaaaaaaatgtCATTGCTACAGAGAACTGTATCTCAGCAGTAGGGAAGATTTTGAGATTTAAGCCTAACTGTGTAAATGTGGATGAAGTTCTTCCACACTGGTTATCATGGCTTCCACTGCATGAGGATAAAGAGGAAGCTATTCAGACTTTGAGTTTTCTCTGTGACTTAATTGAAAGTAACCATCCAGTTGTACTTGGTCCAGATAATTCCAATCTTCCCAAAATAATCAGTATAATTGCAGAAGGAAAAATTAATGAGACTATTAACCATGAAGATCCTTGTGCCAAACGTCTAGCTAATGTTGTGCGCCAGGTACACACTTCTGA |
| >XM_037800250.1 |
| ctcccctccctctttctctctttcacgCCTAGCGCAATGGCGGCGGCCGCGGCGGAGCAGCAACAGTTCTACCTGCTCCTAGGAAACCTGCTCAGCCCCGACAATGTGGTCCGGAAACAGGCAGAGgAAACCTATGAGAATATCCCAGGCCAGTCAAAGATCACATTCCTCTTACAAGCCATTAGAAATACAACAGCTGCTGAGGAGGCTAGACAAATGGCTGCCGTTCTCCTAAGACGTCTTTTGTCCTCTGCATTTGATGAAGTCTATCCAACTCTTCCTTCTGATGTTCAGACTGCCATCAAGAGTGAGCTACTAATGATTATTCAGATGGAAACACAATCTAGCATGAGGAAAAAAATTTGTGATATTGCTGCAGAACTGGCCAGGAATTTAATAGatgaGGATGGCAACAATCAGTGGCCTGAAGGTTTGAAGTTCCTTTTTGATTCAGTTAGCTCTCAAAATGTAGGACTGCGGGAAGCTGCCCTTCATATTTTCTGGAATTTTCCTGGAATTTTTGGGAATCAACAGCAGCACTATTTAGACGTCATCAAACGGATGTTAGTTCAGTGTATGCAAGATCAGGAACATCCATCGATCAGGACATTATCTGCTAGAGCTACAGCTGCATTTATACTTGCAAATGAGCATAATGTTGCTCTGTTCAAACATTTTTCAGACTTATTACCTGGATTCTTACAGGCTGTAAATGATTCATGCTACCAGAACGACGATTCAGTCCTAAAATCTCTTGTTGAGATTGCAGATACCGTTCCAAAGTATTTGCGTCCTCATTTAGAAGCCACTCTACAGCTAAGTCTAAAGTTATGCGGAGACACTAGTCTCAATAATATGCAACGCCAGCTTGCCCTTGAAGTAATCGTGACCCTGTCTGAGACAGCAGCTGCTATGTTAAGAAAACATACCAATATTGTTGCACAGACTATTCCTCAGATGTTAGCAATGATGGTTGATCTGGAAGAGGATGAGGATTGGGCAAATGCTGATGAACTAGAAGATGATGATTTTGACAGCAATGCAGTTGCTGGTGAGAGTGCTTTAGACCGAATGGCTTGTGGACTTGGTGGAAAACTTGTTCTACCAATGATCAAGGAACACATTATGCAAATGCTTCAAAATCCCGACTGGAAATACCGGCATGCAGGATTGATGGCTTTGTCTGCCATTGGTGAAGGATGCCACCAGCAAATGGAAGGGATTCTAAATGAGATAgtaaattttgttttgctttttcttcaggATCCTCATCCAAGAGTAAGGTATGCAGCCTGTAATGCTGTGGGACAGATGGCTACAGATTTTGCACCTGGATTCCAAAAGAAATTCCATGAGAAGGTGATTGCAGCTCTGTTGCAGACAATGGAAGACCAAGGCAATCAACGGGTACAGGCCCATGCAGCTGCTGCGCTCATTAATTTTACTGAAGACTGTCCCAAGTCGCTACTGATTCCATATTTAGACAATTTGGTGAAACatttgcattccattatggtacTGAAACTTCAAGAGTTGATTCAAAAAGGCACCAAGTTAGTTTTGGAACAAGTTGTGACATCCATTGCATCAGTTGCAGATACCGCAGAAGAAAAATTTGTCCCCTACTATGATTTATTTATGCCATCACTAAAGCATATTGTTGAGAATGCAGTTCAGAAGGAACTCAGACTTCTGAGAGGAAAAACTATTGAATGCATCAGCCTCATTGGTCTGGCTGTTGGGAAAGAAAAAttcatgCAAGATGCTTCAGATGTGATGCAGCTATTACTGAAGACTCAGACAGACTTCAATGATATGGAAGATGATGATCCTCAGatttcTTACATGATCTCAGCATGGGCCAGAATGTGCAAAATCCTTGGAAAAGAATTTCAGCAATACCTTCCAGTGGTTATGGGGCCTTTAATGAAGACAGCTTCAATTAAACCCGAAGTAGCACTTTTAGATACCCAAGACATGGAGAATATGAGTGATGATGATGGTTGGGAATTTGTGAACCTTGGAGATCAGCAAAGTTTTGGTATTAAAACTGCAGGGCTGGAAGAAAAGTCAACTGCTTGCCAGATGCTGGTTTGCTATGCTAAGGAGTTAAAGGAAGGCTTTGTGGAATACACTGAACAAGTTGTAAAACTGATGGTCCctttactgaaattttatttccatgatGGTGTTCGAGTGGCAGCAGCAGAATCCATGCCTCTTCTCCTGGAATGTGCAAGAGTTCGTGGTCCTGAGTATCTCACACAGATGTGGCATTTTATGTGCGATGCTCTAATCAAGGCCATTGGCACAGAACCAGATTCAGATGTCCTGTCAGAAATAATGCATTCTTTTGCAAAGTGCATTGAAGTAATGGGAGATGGATGCCTTAATAatgaacactttgaagaactgggAGGTATATTGAAAGCAAAACttgaagaacattttaaaaatcaagaattgCGACAAGTTAAAAGACAAGATGAAGACTATGATGAACAGGTTGAAGAGTCACTACAAGATGAGgatGATAATGATGTATATATTCTGACCAAAGTGTCAGACATTTTACACTCAATATTCAGTAGCTACAAGGAAAAAGTGTTACCATGGTTTGAACAGCTGCTTCCTTTAATTGTCAACCTAATTTGTCCACATAGACCATGGCCAGACAGACAGTGGGGATTGTGCATCTTTGATGATGTAATAGAACACTGTAGTCCAGCCTCATTTAAATATGCAGAATATTTCTTAAGGCCAATGCTCCAATATGTATGTGACAATAGCCCAGAAGTCAGACAAGCTGCTGCATATGGCCTAGGAGTCATGGCACAGTATGGTGGAGATAACTATCGTCCTTTTTGTacagAAGCACTTCCCCTGCTGGTAAGAGTTATTCAGTCTGCAGATTCTAAGACCAAAGAAAATGTCAATGCTACAGAGAACTGCATTTCAGCAGTAGGGAAGATAATGAAATTCAAACCTGACTGTGTAAATGTTGAAGAAGTCCTACCACACTGGTTATCGTGGCTCCCACTGCATGAAGATAAAGAGGAAGCTGTTCAGACTTTCAATTATCTGTGTGACCTAATTGAAAGtaaTCACCCAGTTGTTCTTGGCCCAAACAATACCAATCTGcccaaaatattcaatataattgcAGAAGGAGAAATGCATGAGGCGATTAAACATGAAGATCCTTGTGCCAAACGTCTGGCTAATGTTGTTCGCCAAGTACAGaCTTCTGGAGGATTGTGGACTGAATGCATAGCACAGCTCAGTCCCGAGCAGCAGGCAGCCATACAGGAGCTCCTGAACTCTGCTTGAAGGGCCTTAATATCACCCACCAGAAAACTAACTCCAAATAAACGTTTACCCTTTTGTTtaggtttctttgttttgtttttgagcaaAAGAGAACGATAGTTTGTGCAGGCCATTCTTCTGCAAAGCCACAGCAGCAGGAAAAGAAGCACTGTGTTTCAGAATGGTTTTTAAATGGATTTCTATCATACCACTGAAGAACTTCCCTGTAAACCCTACAGTAGCACTGAAGAGTATTTTTCTATTGGTATAACCCACCCATGTGAAGGTGAAAGGGAAATAAGATTAATTTTCTCATTAGACATaaggaaatttaagaaaaaaacaattttaagatCAGTTGCTCAGCATAAATATGCATTAAATTGCTATACACCTAGTGTTAATTCTATTAATTGGAGTGTGAGTCTTTGTAAGGTAGAAAGAAGCCTTCTACCCAGCAAACCAGTAGATCCAAAAGTTGAAAAACCGAAGACAAAAGCAGGCATGAAGATCTCATTTGGTGTCACTTATGGTTCTTTTACGCAAAAGGCTTGTGACTCAATTTGGAAAGCTTTCAGCTTCCAGCCCTTGAATGTGAAGTGTTGTTGGCATGTCTGACAGTAGTCTCATTCACTCCTCAATAAACAACATTGAAATACAAAAGAAGCTTGTGTAAAAATTCA |
| PMID - Link | Title |
|---|
