| Retrocopy Name | CHMP1 |
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| Species | Papio anubis | |
| Coordinates | chr1:211061066-211062258 UCSC | |
| Strand | - | |
| Parental Sequence | XM_031660756.1 | |
| Parental seq. overlap | 984 bp | |
| Parental seq. overlap (%) | 17.3% | |
| Genomic Region |
Intergenic |
|
| Retrocopy Summary | CHMP1, located on chr1:211061066-211062258, is a retrocopy of the parental gene CHM. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
| Gene Name | CHM |
| Full Name | N/A |
| Also known as | - |
| Coordinate | chrX:67186491-67380131 |
| Strand | - |
| Gene summary | N/A |
| >CHMP1 |
| TTAAAGAAGGGAGGAGGTTTAATATTGATTTGGTATCAAAACTGCTGTATTCTCAAGGATTGCTAATTGATCTTTTAATCAAATCAGATGTTAGTCGTTatgtagaatttaaaaatgtcaCTAGGATTCTTGCATTTCGGGAAGGAAAGGTAGAACAAGTGCCTTGTTCCAGAGCAGATGTCTTTAATAGCAAGGAACTCACCATGGTTGAAAAGAGGATGCTAATGAAATTTCTCACATTTTGTTTAGAGTATGAACAACATCCTGATGAATACCAAGCTTTCAGGCAGTGTTCATTTTCAGAatacttaaaaactaaaaaactaacTCCCAACCTTCAACATTTTGTACTGCACTCAATTGCAATGACATCAGAATCATCTTGCACTACAATAGATGGCCTTAACGCAATTAAAAACTTCCTTCAGTGTCTCGGACGGTTTGGCAACACTCCCTTTTTATTTCCCTTGTATGGCCAAGGAGAAATTCCCCAGTGTTTCTGTAGGATGTGTGCAGTTTTTGGTGGAATCTATTGTCTTCGTCATAAAGTACAATGCTTTGTAGTCGACAAAGAATCTGGACGATGTAAAGCAATTATAGATCACTTTggtcaaagaataaatgctaaatattttattgtggaagacagttacCTTTCTGAGGAAACATGCTCAAATGTGCAGTATAAGCAGATCTCTAGGGCAGTACTCATTACAGATCAGTCTATACTAAAGACAGATTCAGATCAGCAGACTTCCATTCTGATAGTTCCTCCAGCAGAGCCAGGAGCTTGTGCTGTACGGGTCACAGAATTATGTTCTTCAACCATGACATGCATGAAGAACACCTATCTGGTACATTTGACATGTTCATCTTCTAAAACAGCAAGAGAAGACTTAGAATCAGTGGTGAAGAAATTATTCACTCCATATactgaaacagaaataaacaaggaAGAACTTACAAAGCCAAGACTCTTGTGggctctttattttaatatgaGAGATTCCTCGGGAATCAGCAGAAGCTCATATAATGGCTTGCCTTCCAATGTTTATGTCTGCTCTGGGCCTGACTGTGGCCTGGGAAATGAGCATGCCGTCAAGCAAGCTGAAACACTTTTCCAGGAGATCTTTCCAACTGAAGAATTCTGCCCTCCACCTCCAAATCCAGAAGACATTATCTTTGATGGC |
| >XM_031660756.1 |
| TGAGGTAGTCCGGAGTCAGCGCGGGAATTGGCAGTTACAGGGAGGGGCTTGGACCCGCAGTGCTTATCGCCATTTGAGTAGGGGTTGATCTGGTCGATGCTGATTGCTGAGGTTGGTTGCTGCGGTGATTCCTGTTAATTTCCTTAGAGGGAAGTGGATATGCAGTGTCATGAAATGGAGGGTCGGGATTTTATCAACGGAGACGACTTTGGCAAGACATTATGATTCCTTCCTTATTGATTTCAAGGTTTGCCTGAATCCATCATTGCAGCTGCATGTTCAAGAAGTGGCCGGAGAGTTCTGCATGTTGATTCAAGAAGCTACTATGGAGGAAACTGGGCCAGTTTTAGCTTTTCAGGACTATTGTCCTGGCTAAAGGAACACCAGGAAAACAGTGACATTGAAAATGACAGTCCAGTGTGGCAAGACCAGATCCTTGAAAATGAAGAAGCCATTGCTCTTAGCAGGAAGGACAAAACTATTCAACATGTGGAAGTATTTTGTTATGCCAGGATTTGCATGAAGATGTAGAAGAGGCTGGTGCACTGCAGAAAAATCATGCTCTTGTGACATCTGCAAACTCCACAGAAGCTGCAGATTCTTCCTTCCTACCTATGGAGGATGAGTCATTAAGCACTATGAACTGTGAAATGCTCACAGAACAAACTCCAAGCAGTGATCCAGAGAATGTGCTAGAAGTAAATGGAGCTGAAGTGacaggggaaaaagaaaaccactgtgATGATAAAACTTGTGTGCCATCAACTTCAGCAGAAGACATGAGTGAAAATGTGCCTATAGCAGAAGATACCACAGAAcaaccaaagaaaaacagaattacttACTCGCAAATTATTAAAGAAGGCAGGAGATTTAATATTGATTTAGTATCAAAGCTGCTGTATTCTCGAGGATTACTAATTGATCTTCTAATCAAATCTAATGTTAGTCGATATgcagagtttaaaaatattaccagGATTCTTGCATTTCGAGAAGGACGAGTGGAACAGGTTCCTTGTTCCAGAGCAGATGTCTTTAATAGCAAACAACTTACTATGGTAGAAAAGCGAATGCTAATgaaatttcttacattttgtaTGGAATATGAGAAATATCCTGATGAATATAAAGGATATGAAgatattacattttatgaatatttaaaaactcaaaaattaacCCCCAACCTCCAATATATTGTCCTGCATTCAATTGCAATGACATCAGAGACAGCCAGCAGTACCATAGATGGTCTCAAAGCTACCAGAAACTTTCTTCACTGTCTTGGGCGATATGGCAACActccatttttgtttcctttgtatgGCCAAGGAGAACTCCCCCAGTGTTTCTGCAGGATGTGTGCAGTGTTTGGTGGAATTTATTGTCTTCGCCATTCAGTACAGTGCCTTGTAGTGGACAAAGAATCCAGAAAATGTAAAGCAATTATAGATCAGTTTGGTCAGAGAATTATCTCTGAGCATTTCCTCGTGGAGGACAGTTACTTTTCTGAGAACATGTGCTCACGTGTGCAATACAGGCAGATCTCCAGGGCAGTGCTGATTACAGATAGATCTGTCCTAAAAACAGATTCAGATCAACAGattTCCATTTTGACAGTGCCAGCAGAGGAACCAGGAACGTTTGCTGTTCGGGTCATTGAGTTATGTTCTTCAACGATGACATGCATGAAGGGCACCTatttgGTTCATTTGACTTGCACATCTTCTAAAACAGCAAGAGAAGATTTAGAACCAGTTGTGCAGAAGTTGTTTATTCCATATACTGAAATGGAGatagaaAATGAACAAGTAGAAAAGCCAAGAATTCTGTGGGCACTTTACTTCAATATGAGAGATTCGTCAGACATCAGCAGGAGCTGTTATAAAGATTTACCATCCAACGTGTATGTCTGCTCTGGCCCAGATTGTGGTTTAGGAAATGATAATGCAGTCAAACAGGCTGAAACACTTTTCCAGGAAATCTGCCCCAGTGAAGATTTCTGTCCCCCTCCACCAAATCCTGAAGACATTGTCCTTGATGGAGACGGTTTACAGCCAGAGGCTTCAGAATCCAGTGCCATACCAGAGGCTAACTCAGAGACTTTCAAGGAAAGCACAAACCTTGGAAACCTAGAGGAGTCCTCTGAATAATGGATATACACCGAACTGGATACCCAACTTTGGAAATTTCTACTGGTCTCAGAGTCTGCTTGATAGAAAGACTGTTTGAAAAATGTTAGAAAGCAACAGCAATTATAAGGCAAAATGGGTAATAGAAATCCAAAAGGGGATTTTCCTTATAGAGGACGTTACAAGAACACACAACACTTACAAAGCACATTGACTTGCTCATTTTGAATACCAAACTTGTGTGACTAgcagatgaaaattataaatcaattgATTCTCAGGAATGTAACTGTGGATATGAAAGTGATCCTATGCATTGTTAATAATTCCGTGGTCTTAGGACAATTTTGCTTACCACTATGGATCTTTGTTTGAAAGCCACATTTTCAGAACCAGCTCACATATTTTCTTTGgttatttgaattatattttctttatggaCAAGAGCATCATAGCATAATGataaaaacatatagaaaaactAAAGTATCATGATCTAGATAGAAGCCTGTATTTAGAAtacaggtttgttttgttttgttttgctttctatgTTGAGAAGCATTGAAAATGCTAATACAAAGGTGTTTAGGCATTGTTAAGAACAAGTCAGTAGTGTTTTTTAGTATCAGTAGTGATATTTGTTtgtaaattatttacatattggGAAAGGTCAATAATGAAGAAgtgaaagaatggaaggaaaggtGTGGATAGGCTCATTGATATTTGGATGTTCTGTCTGTCAAATAACTAGAGTATTAGGCTAATTGTCTACAGACCTAATTTAATCCTGGCTGTCCTTCTGATGATATGTGgtaaattgtttaatttctgaGCCTACGTTTCTCCATATATAAAGTGGAAATAGTATTACTATGCCTACTGTATGAGAGTGGTTATGAAGACCAATGCAATGCCATGTTTAGAATGGGTTTGCCAGAAGAAAATCGTTTTAGAATTTTCCCATTGACTTGATGAATCTCAGAAGTCTCACGCAGGAAATAATTGCTTGTTGTCAGTCAACAAATGAAATAGATCACGCATTTTTATTGCATTAagctttttaaatggaaatttctttttaaaattagtattttatattcttacatACAGACCAGTAAAAATAGTAACAAGTAGAATTATGGTTTTGAAATATTACTAAGGAAAACACTCTATAAATTGTTAATACTCCTTTTCTGGTAGGTAAACCTGCAACCACCAAGGGCTCCAAATTGTGTATGATAGTTGGCAAGCCCTAAAATACACTCTACATAAAAATGTTAGGgttgcctctaatcccagcactttgggaggctgagacgggcagatcacttgaggtcaggagtttaagaccagcctggccaacatgacgaaaccccatctctactaaaaatacaaaattttagctgggtgtgatagcgggcacctgtaatctcaactactttggaggctgagataggagactcacttgaaccagggaggcggaggttgcagtgagccaagattgtgccactgcactcagcctgggtgacagagcaagactctgtctcaaaaaaaaaaagaagttagggCTGTACATAGGCAGCAAACCAAGCTACAGTGACGTTGCctgtatttaaattttctcaaatggCCAAGCTCTGATGGTCTACTTTATTTGAGTAATAGTTTAGACTTACAATTGCctgtaaataaacaaacaaatgcactcttagtttttttggttttttgggtttttttccacaAGATCTGGCCTATATTGTCTGTCAGGAAGCCATGGCTCCAATGTAAAGTACATAGTTCTTACATACTTCAACTGCAGCTGGTCCCTGACCTCATCAGGTTTCAGAGATGTTCTTAAAGGAAGCCAGCTGTGACAGGTCACAGATTGATGGGAAATGGAAAGAACCAAGGAACGTAGCTCTTGCCTCACCTTTCTACCCACTGCAGATGTAGTTCAAGCCAGAATAATGGAAGAACTTAACTAACTAGCCTCTCAGGCTGCTCCTATCCCTACCTCCCAGTGTACAGCCCCTCCCCATCTCTTTAGTCCCCTTTCCTTCGCTTCCCCTTTTATAATGTCACATAAATCAGGGACAGTAGGATCACATTATAACCTACTTTGTCACAGGGATTCGATTTTTCTTATATCAAATCATGTTTCCTGAAACCCAGCTGGGGCATATGCACTCAATGTCTAATACATACCTATTAATGTACCAGGTATTGGCCTTGCTCCTGAATATCAGCAATATATTATAAAAGATTCCAGTAGATGAGACGATTGAGTCTGAGTACAATTGCAGTAAATTCTGCCAATAAAGATATTGTACTGTTACGGTCTTAGAGTTAAGGCCACTTGAATGCAGTATGCACATTCATGTAAACAGACAATCAGGGTAGGCCTAGAATAACCACAAAAATTCTATTGGCCTTACTACAGCCGCCTATGTATAGAACAATGGAGGAGATAGTTTGTGGTCCATTATTGTACCCTGTTTCATCCATTAGCCAGCAGCAGAATCTCTCTTTCAGGTCATTTATTAAATACGattgaaatgtttaaaagttcCTGAACATGATTCGTGATGATTAAAATATCATATGACTGATAAAAGACTTTAAGAACTTCAGATATTACCTGTTGCCTCAAAATGTAACAGAAATTATTCTTAGAGCTTTCTTTTTAGCTATCCTAATTActgccaataaatatttgttcttatagttttaaatctaaaagaaaaatcttttggttttgttttaaaacctTAAACTTGAAgtcatattaataaaattaatatattgtaCATAGTGGAAAATTTTCAGtagctaatttaaaatttcaaaaaatgctATTAA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