| Retrocopy Name | CHMP1 |
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| Species | Felis catus | |
| Coordinates | chrF1:10069411-10070626 UCSC | |
| Strand | + | |
| Parental Sequence | XM_019824051.1 | |
| Parental seq. overlap | 923 bp | |
| Parental seq. overlap (%) | 12% | |
| Genomic Region |
Intergenic |
|
| Retrocopy Summary | CHMP1, located on chrF1:10069411-10070626, is a retrocopy of the parental gene CHM. Retrocopies of protein-coding genes, also known as processed pseudogenes, are intriguing genomic elements with implications in genome evolution and diseases. While some retrocopies are non-functional, there are examples of retrocopies (retrogenes) acquiring regulatory roles or exhibiting neofunctionalization unrelated to their parental genes. |
| Gene Name | CHM |
| Full Name | CHM Rab escort protein |
| Also known as | - |
| Coordinate | chrX:73736860-74003586 |
| Strand | - |
| Gene summary | N/A |
| >CHMP1 |
| GAAATAGGATTACTTACTCTCAAATAGTTAAAGAAAGCAGGAGGTTTAATATTGATTTGGTATCAAAGCTCCTGTATTCTCAAGGGTTGCTGATTGATCTTTTAATCAAATCAAATGTTAGTCGTTATGCAGAATTTAAAAATGTCACTAGGATTCTTGCATTTCGAGAAGGAAAAGTAGAGCAGGTGCCTTGTTCCAGAGCAGATGTCTTCAATAGCAAAGAACTCACTATGGTTGAAAAGAGGATACTAATGAAATTTCTTACATTTTGTTTAGACTATGAACAACATCCTGACCAATACCAAGCTTTCATGCAATGCTCATTTTCAGAGTACTTAAAAACTAAAAAATTAACCCCCAACCTCCAGCATTTTGTACTGCACTCCATTGCAATGACAGAATCATCTTGCACTACAATAGATGGCCTTAAAGCAACAAAAAACTTCCTTCAGTGTCTTGGACGGTTTGGCAACACTCCCTTTTTATTTCCCTTATATGGCCAAGGAGAAATTCCCCAGTGTTTCTGCAGGATGTGTGCAGTTTTTGGTGGAATCTATTGTCTTCGCCATAAAGTTCAATGCCTTGTAGTTGACAAAGAATCTGGAAGATGTAAAGCAATTATAGATCACTTAGGTCAAAGAATAAATGCTAAATATTTTATAGTGGAGGATAGTTACCTTTCTGAGAAAACATGCTCAAATATACAGTATAAGCAGATCTCCAGGGCAGTGCTCATTACAGATCAATCTATACTGAAGACAGATTCAGATCAGCAAATTTCCATTTTGATAGTGCCTCCAGCGGACTCAGGAACGTGTGCCGTTCGTGTCACTGAATTATGTTCTTCAACCATGACGTGCATGAAAGACACTTATCTGGTACATCTGACCTGTTCCTCCTCTAAAACAGCAAGAGAAGACTTAGAGTCAGTAGTAAAGAAACTATTCACTCCGTATACTGAAGCAGCAATAAATGAGGAGGAACTTACAAAGCCAAGACTCTTGTGGGCTCTTTATTTTAATATGAGAGATTCCTCCGGAGTCAGCAGAAGCTCATATAATGGCTTACCGTCCAATGTTTATGTCTGCTCTGGGCCCGACTGTGGACTGGGAAATGAGCATGCGGTCAAGCAAGCTGAAACACTGTTCCGGGAGATCTTTCCAAGTGAAGAATTCTGTCCCCCACCTCCAAATCCAGAAGACATTATCTTTGATGG |
| >XM_019824051.1 |
| GCGATAGTCACATGACACGTTTTCTCTCAAGATGGCGGATAATCTCCCTTCGGAGTTTGACGTGATCGTAATAGGGACGGGTTTGCCTGAATCCATCACTGCAGCTGCATGTTCAAGAAGTGGCCAGAGGGTTCTGCATGTTGATTCAAGAAGCTACTATGGAGGAAACTGGGCCAGTTTTAGCTTTTCAGGACTATTGTCCTGGCTAAAGGAATACCAGGAAAACAGTGACATTGTGAATGAAAATCCAGCATGGCAAGAGCACATTCTTGAAAATGAAGAAGCTATTGCTCTTAGCAGGAAGGACAAAACCATTCAACATGTGGAAGTATTTTGTTATGCCAGTCAGGATTTGCATGAAGATGTTGAAGAAACTGGTGCACTGCAGAAAAATCATGCTTCTGTGACATCTGTGAACCCCACAGAAGGGGAACATTCTGCCTATCTGCCTTCGGAAGATGAGTCGTCCAGCACTGTGAGTTGTCAAATGCCCACAGAACAAACTCCAAACAGTGATCTAGAGAGTTCCCTAGAAATAAATGATGTTGAAGCAACAGGGGAAGAAGAAAAGCGTTGTGATGATAAAACTTGTGTGAAGTCAGCTTCAGAAGAAGAAACAAGTGAAAATGTGCTTACAACAGAAGACACCACACTGCAACCAAGGAAAAATAGGATTACTTACTCACAAATTATTAAAGAAGGCAGGAGATTTAATATCGATTTAGTATCAAAGCTGCTGTATTCTCGAGGATTACTAATTGATCTTTTAATCAAATCTAATGTAAGTCGATATGCAGAGTTCAAAAATATTACCAGGATTCTTGCATTTCGAGAAGGAAGAGTGGAACAGGTTCCTTGTTCTAGAGCAGATGTCTTTAATAGCAAACAACTTACTATGGTAGAAAAGCGAATGCTAATGAAGTTTCTTACATTTTGTATGGAGTATGAAAAACATCCTGATGAATATAAAGCCTATGAGGAGATTACATTTTCTGAGTATTTAAAAACTCAAAAATTAACCCCCAACCTCCAGTACTTTCTCCTGCATTCAATTGCAATGACATCAGAGACAGCCAGCAATACCATAGATGGTCTCAAAGCTGCCAAAAACTTTCTTCACTGTCTTGGGCGGTATGGCAACACTCCATTTTTATTTCCTTTATATGGTCAAGGAGAACTTCCTCAGTGTTTCTGCAGGATGTGTGCTGTGTTTGGTGGAATCTATTGTCTTCGCCATTCAGTCCAGTGCCTTGTTGTGGACAAAGAATCCAGAAAGCAAATCTCCAGGTCAGTCCTGATTACAGATAGATCTGTACTAAAAGCGGATTCAGATCAACAGATTTCCATTTTGACAGTGCCAGCAGTGGAGACAGGAACTTTTGCTGTTCGGGTCATTGAATTATGTTCCTCAACAATGACATGCATGAAAGGCACATATTTGGTTCATTTGACTTGTACATCTTCTAAAACAGCAAGAGAAGATTTAGAACCAGTTGTGCAGAAATTGTTTACTCCATATACCGAAACGGAGATAGAAAATGAAGAAGATGAGAAACCAAGACTTTTGTGGGCTCTTTACTTCAATATGAGAGATTCTTCAGATGTCAGCAGGAACTCTTATAATGATTTACCATCCAACATTTATGTCTGCTCTGGCCCAGACTGTGGTTTAGGAAATGATAATGCGGTCAAACAGGCTGAAACACTTTTCCAGCAAATCTGCCCCAACGAAGACTTCTGTCCACCCCCACCAAATCCTGAAGACATTGTCATTGATGGGGACAGTTTACAATCAGAGGCTTCGGAATCTAGTTTCATACCAGAAGCGAACTCAGAGACTCCCAAGGAAAGCAGAAGTCTGGGAAACCCAGAGCTGTCCTCTCAATAATGGGTATACACCAAACTATACACGCACTTTGAAAATTCCTCCTGGCCTCAGAGTCTTCTTCATGGAAGAAATGTTTGAAAAATGTTAGAAAACAGCAGCCAGTTGACATACATTATTACCAAGAGAACAGGGCATAGAAATCCAAAAGGGGATTTTCCTGAAAGAGGACATTGCAAGAGCACAAAATACTTGTAAACCACATTGGCTTGCCTACTTAAAGATAATACACCTGTGGAATTAGCAGATGAATATAAATGGATTGATTCCCAGGAATATAGCTGTGGATATGAAAGTGATCCTATGCATTGTTAGTAATTCTGTGGTATTAGGAAAGCTTTTGCTTATCACTTTGGGTCTTTGATTGAAATCCACATCTTCAGAATCCAGTCATGTATTTCCTGTGATTATTTTAATTCTATTTTCTTTATGGATATAAGCATGATGGCACCAATGATAAAAGCACATGTAAATGTAATTGAGGAGAGCTAAAATATCCTGATCTAGGCAGGAGCCTATGTTCGGAATAGAGGTTTGGCTTGTTTTCTATCTTGAGAATTACTGAAAACGCCAATATTAAGGTATACATTTTTACAAACAAATCATGAGTCCATGTACTCAACATTTTTTAATGTTAGTAGTGCTATTTGTATGTGAATCATTTGCATACTAGGAAAGCTTATAGGACTGAAGGAATGGAAGGAAAGATTTGGATATGCTCATCAGTATGTGGAAATTCTGTCTAGTCAAGTAATTAGAACCTAATTGTATATGgacccagtttagtcctagctgtactactgatgagattagacaaattgtttattttgtctaaaaatagggctcactttctccatatgtaagatagaaatagtaacactctccctaccttaggaggatgattttgaagataaatgCAGTGCAAACCTTAAAATGATTTTTGGGGGGTTGGGGGGAATGTTGTTTTCCCCTTGACTTGAAGGTGAATATCAAAAATCTCATGCAGCAAATTGTTTGCTGTCAACTCCCCCAACACAGTAGTTCACAGTGTTTTTATTGCATTAAGCTTTTAAAATAAAACTATTTCCTAAATTAGTATTTTATAGTCTATAGGCCATAAAACATAGTAACATGGAATTTTGGTTTTGAATCTTAATAAGGAAAGCACTGTATAAATTATTCATATTCCTTTTCTGGTAGGTAAACCTAAAACCACTAAAGACTCTCAATACAATATGACAATTGGTAAACCCTAATATACACTTAACATAAAAATGTTAGGGTTGTACATAGCCAGCAAACCTAGTTACAGTGACCATGACAATTTAAAATTTTTCCAGGTGCCAAGCTCTGATGATTTGCTTTATTTGAGCAATAGTTTAGACTTAATTTGTTTCAATAATTAAATACATAAAATGTTTATTGTGCATTCTGGCCTATATTGCCAATCAGAGAGCCAAAGCTATAGTAGAAATCATGTAGTTCTTACTTCAGTTGCAGTGGGGCTATGAGCTCTTCAGGTCACAGACTCCTAAGAAATGGAAAGAACCAAGGAATGTAGCCCTTGCCTCACCTTTCCAATCCCCTATAGATACAATGGAATCCAGGTGAAAGGAAAACCTTCCCAGCCTTTCAGGCTGCTCTTAACTGCTCTGCCCATTGTACAGCCCATCTCCTCTCTCTTTGGACCCTTCTGTGTCTCTCTTCCCCTTTTATATTATCATACAAATCAGGGATagtggaatcacattataatatattctgttaatagattcagatcttaaatcatgtttcccaaaacccaacttatgccatggtctaaatgcacaatacatacctagaagcaccaggtattggccctgcccctcaataccagcaatatgaaaggtcccactgTATAAAAGtattgagtctaaatacaatggcaccaattaaaatactgtactttgttacagtctaagagttaaggcctcttgaatacagcatacatatttatgtaaaCAATCAGAGTAGGCTCAGAATAATAACTAGAAAATTACAATAGCTTTACTGCAGCTATCTATATGTAGACAAGGAGATATTTTGTGGTCTCATGGCCCAACCCGTATTGTACCCTATTTTATCCATTAGCCATCCGCATAATCTCTTCCAGGTTATTTATTAAATACTATTGAAATATTTAAAAGTTCCTAAATATGATTAGTGGTGACTAAAATATTACACAACCGTTTAAAACATTTTGATAGAGAATCTTAAATATTTCCTGTTGCCTCAGAATGTAATAGAAATTATTCTAAGAGCTTTCTTTTCAGCTGTCTTAAGTACTGCAAATAAATTTTTTTATAGTTTTAAAACAAAAAACTTTTTGGTTTTGTTGTAAAATCATAAGCCTGAAGTTATATAAATAAAGTTAACATGTTATATGCAATACAGAAGTTTCAGTAGCTAATTTAAAATGTTGAACATTATTGTCAAAGAATTTTGATTCATATGTTTAAAATGTTTAGTTATGCATGCTTTTTTAACCAAACATGATAATACCACTCAGTTTAGTGTTCTATATGAAAGCCAATTACCCTGTGTTGCTACTGTGTCTTTGTCTAGTTGGTATGCCTATCCAGAAAAGCagataggtaggtaggtaggtagataggtagatagataCTATAAATTTAGGTATTTTCTATAGGAAAACTGAATTACAATTTTTCCCATCTCCAGTGATACTTAAGGTGCCTGTAGTAAAATGGCCACGTTAATAGTTAACTTCTAGAATGGTAGTTTCTGAGATTGGCAGCCTTTTATCTAAAATAATGACCATGCTAATGATTAACTTCTGTCACAGCTGTACTTCCCAAGAAGGCAGCCCTTTGTCTAAAGTCCTAAAGATCTCAAAAAATTTTGTTGAAATTTGATTGCTAAGTAGTATTGATCCTTCAAAGCAATAATTAATTTTCTTACAAGTAAGTTATTTACTGCTATTGGTATTGAGTGATCTATCTCTACTCCTGGGTAATTTTCTTATATGCACTTCAAAAGCATAAATATGATTATTCATAATTTTCACACAGTAACAGTAAGTTTTCAGAGGAAGTAAAATCTGTTTTGATGCCTT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